59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1684 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 
236 aa  493  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  61.28 
 
 
241 aa  311  5.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  59.15 
 
 
240 aa  308  4e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  63.83 
 
 
237 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  58.64 
 
 
224 aa  265  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  49.79 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  49.57 
 
 
263 aa  249  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  29.96 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  29.91 
 
 
248 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  27.54 
 
 
251 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  27.93 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  29.05 
 
 
234 aa  92.8  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  29.05 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  27.02 
 
 
236 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  30.32 
 
 
236 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  26.78 
 
 
238 aa  86.3  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  27.97 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  27.54 
 
 
234 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  28.4 
 
 
235 aa  77  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  26.58 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  25.93 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  28.23 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  25.21 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  28.75 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  27.6 
 
 
550 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  34.65 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  25.69 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  22.91 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  26.05 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  26.82 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  25.2 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  25.51 
 
 
237 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  33.86 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  23.98 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  23.98 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  23.98 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  23.98 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  33.07 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  25.1 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  28.47 
 
 
238 aa  59.3  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  23.71 
 
 
237 aa  58.5  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  21.93 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  22.49 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  24.89 
 
 
243 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  21.89 
 
 
227 aa  52.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  22.5 
 
 
234 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  20.55 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  22.41 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  21.74 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  21.36 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0591  hypothetical protein  54.55 
 
 
45 aa  48.9  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.425982  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  21.95 
 
 
222 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6988  DNA alkylation repair enzyme  19.38 
 
 
233 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25051  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  21.23 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  22.38 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  22.38 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  22.38 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1298  hypothetical protein  22.5 
 
 
235 aa  42  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  21.3 
 
 
229 aa  42  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>