35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1843 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 		 238 aa  461  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  47.66 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  49.78 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  47.68 
 
 		 550 aa  195  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  40.52 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  40.3 
 
 		 243 aa  148  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  34.1 
 
 		 238 aa  141  8e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  35.78 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  35.89 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  30.25 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  40.89 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  38.16 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  39.72 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  30.42 
 
 		 242 aa  131  9e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  35.42 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  36.52 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  37.56 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  34.34 
 
 		 235 aa  121  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  37.09 
 
 		 243 aa  108  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  27.17 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  30.95 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  25 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  31.11 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  28.47 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  29.84 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  28.35 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  29.6 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  29.89 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  23.75 
 
 		 251 aa  48.9  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  25.51 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  31.58 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  28.48 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  28.48 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  28.48 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>