42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2024 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 		 251 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  55.33 
 
 		 248 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  29.71 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  27.54 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  31.11 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  27.54 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  28.99 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  26.45 
 
 		 263 aa  95.5  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  25.21 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  26.94 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  27.31 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  24.89 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  28.68 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  23.14 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  24.05 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  24.89 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  23.24 
 
 		 550 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  27.07 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  27.48 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  26.72 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  24.86 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  23.5 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  22.82 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  23.61 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  26.47 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  23.87 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  23.75 
 
 		 238 aa  48.9  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  19.28 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  22.13 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  24.43 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  24.89 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  24.89 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  24.89 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  24.89 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  24.8 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  24.89 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  24.81 
 
 		 234 aa  45.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  24.28 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  22.92 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  23.94 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  24.22 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  24.31 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>