48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2054 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 		 227 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  59.42 
 
 		 229 aa  244  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  52.23 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  49.09 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  48.46 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  44.25 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  44.25 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  44.25 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  49.12 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  34.38 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  33.48 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  33.93 
 
 		 237 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  33.93 
 
 		 237 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  33.93 
 
 		 237 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  33.93 
 
 		 237 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  33.48 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  35.1 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  33.48 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  33.04 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  30.18 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  37.12 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  31.05 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6988  DNA alkylation repair enzyme  34.36 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2437  DNA-7-methylguanine glycosylase  33.84 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000187196  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3013  DNA-7-methylguanine glycosylase  33.33 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1132  hypothetical protein  26.73 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110676  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1275  DNA alkylation repair protein  30.59 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0157146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  29.87 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  29.61 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  27.11 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  31.49 
 
 		 550 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  22.12 
 
 		 248 aa  52  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  29.65 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  37.5 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  28.03 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  22.13 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  31 
 
 		 245 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  21.23 
 
 		 236 aa  45.1  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  33.72 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  25.51 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  35.23 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  33.64 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  33.02 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  31.31 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  27.07 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  24.62 
 
 		 232 aa  42.4  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  28.17 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2954  hypothetical protein  30.38 
 
 		 415 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>