37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0250 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 
235 aa  481  1e-135  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  52.42 
 
 
236 aa  227  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  48.03 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  49.11 
 
 
243 aa  218  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  45.65 
 
 
236 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  49.11 
 
 
238 aa  211  9e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  48.42 
 
 
232 aa  201  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  48.58 
 
 
242 aa  198  6e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  43.97 
 
 
234 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  47.35 
 
 
247 aa  188  5.999999999999999e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  47.11 
 
 
257 aa  186  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  42.37 
 
 
243 aa  185  7e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  46.32 
 
 
234 aa  181  9.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  43.53 
 
 
236 aa  176  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  39.83 
 
 
237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  45.07 
 
 
243 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  40 
 
 
236 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  39.07 
 
 
550 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  38.32 
 
 
239 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  34.34 
 
 
238 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  28.4 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  26.25 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  28.88 
 
 
224 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  27.39 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  26.67 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  26.9 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  24.79 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  25.52 
 
 
248 aa  57  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  25.52 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  22.22 
 
 
261 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1298  hypothetical protein  24.76 
 
 
235 aa  48.5  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  24.9 
 
 
251 aa  48.5  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  22.12 
 
 
217 aa  45.4  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  20.89 
 
 
233 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_520  hypothetical protein  24.88 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0581  hypothetical protein  24.76 
 
 
240 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  21.93 
 
 
234 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>