53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1710 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 		 238 aa  479  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  55.98 
 
 		 236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  50 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  46.22 
 
 		 243 aa  228  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  44.25 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  43.48 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  42.13 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  45.61 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  48.21 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  44.44 
 
 		 257 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  44.54 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  44.71 
 
 		 232 aa  188  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  40.44 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  40.61 
 
 		 247 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  39.74 
 
 		 550 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  40 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  41.13 
 
 		 243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  41.23 
 
 		 243 aa  171  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  38.01 
 
 		 239 aa  171  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  34.1 
 
 		 238 aa  141  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  30 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  26.16 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  26.78 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  25 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  27.54 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  27.59 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  24.23 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  30.47 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  23.28 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  26.29 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  26.29 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  26.9 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  26.29 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  22.28 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  24.23 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  25.14 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  27.11 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  27.11 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  25.2 
 
 		 229 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  20 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  24.8 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  22.47 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  23.44 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  26.6 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  25.57 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  23.84 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  23.84 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  23.84 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  23.84 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  23.84 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  23.84 
 
 		 237 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  19.27 
 
 		 234 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>