59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1291 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 		 233 aa  453  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  61.33 
 
 		 225 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  60.81 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  56.39 
 
 		 227 aa  244  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  26.84 
 
 		 237 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  26.84 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  26.69 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  26.84 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  26.84 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  26.84 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  26.84 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  26.41 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  25.97 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  26.41 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  32.88 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  33.62 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3013  DNA-7-methylguanine glycosylase  30.58 
 
 		 231 aa  72  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  29.02 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  30.36 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  29.11 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6988  DNA alkylation repair enzyme  28.75 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  30.04 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  26.34 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  30.73 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  29.51 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  28.7 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0581  hypothetical protein  25.76 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_520  hypothetical protein  26.56 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4304  hypothetical protein  27.51 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.648821  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  23.14 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  22.37 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  27.5 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  23.87 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  25.32 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0555  DNA alkylation repair enzyme-like protein  23.59 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  27.98 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  27.73 
 
 		 550 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  24.89 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  26.03 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  24.14 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  25.46 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  24.55 
 
 		 236 aa  52  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0836  hypothetical protein  28.9 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206706 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  22.41 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1298  hypothetical protein  26.63 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  20.56 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  25.42 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  26.39 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  28.03 
 
 		 227 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2664  hypothetical protein  25.76 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  23.21 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2073  hypothetical protein  23.38 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  25.21 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  20.89 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  22.37 
 
 		 241 aa  42.4  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2310  hypothetical protein  23.44 
 
 		 227 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>