41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4207 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  29.96 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  29.91 
 
 
240 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  27.93 
 
 
263 aa  105  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  30.48 
 
 
241 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  27.5 
 
 
250 aa  101  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  29.86 
 
 
224 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  29.05 
 
 
237 aa  89  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  29.28 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  25.21 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  29.65 
 
 
234 aa  72  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  25.46 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  26.94 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  30 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  24.23 
 
 
238 aa  67  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  28.14 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  32.81 
 
 
234 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  32.58 
 
 
239 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  26.36 
 
 
550 aa  62.4  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  26.46 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  30.43 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  26.77 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  27.41 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  28 
 
 
225 aa  58.9  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  24.27 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  29.23 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  28.89 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  29.89 
 
 
238 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  35.87 
 
 
243 aa  52.4  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  29.3 
 
 
234 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  21.54 
 
 
261 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  26.87 
 
 
257 aa  52.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  29.03 
 
 
229 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  26.02 
 
 
236 aa  47.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  26.6 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  30.11 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  30.11 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  30.11 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  29.01 
 
 
228 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  31 
 
 
227 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  26.04 
 
 
223 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>