55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3188 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  56.39 
 
 
233 aa  244  9e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  53.1 
 
 
225 aa  222  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  51.13 
 
 
234 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  28.09 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  31.72 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  24.78 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  24.35 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  27.31 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  24.45 
 
 
237 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  24.45 
 
 
237 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  24.45 
 
 
237 aa  62.8  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  24.45 
 
 
237 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  28.32 
 
 
236 aa  61.6  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  23.48 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  23.91 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  23.04 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6988  DNA alkylation repair enzyme  25.32 
 
 
233 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25051  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  31.13 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3013  DNA-7-methylguanine glycosylase  25.54 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0555  DNA alkylation repair enzyme-like protein  25.64 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  30.46 
 
 
247 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  23.04 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  31.16 
 
 
237 aa  52.4  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  21.89 
 
 
236 aa  52.4  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  27.23 
 
 
234 aa  52.4  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  29.84 
 
 
236 aa  52  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1132  hypothetical protein  28.1 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110676  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  22.92 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  25 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  23.64 
 
 
232 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2310  hypothetical protein  29.51 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  25.89 
 
 
237 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  19.55 
 
 
240 aa  48.9  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  28.51 
 
 
234 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  24.2 
 
 
234 aa  48.5  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  35.63 
 
 
257 aa  48.5  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  27.87 
 
 
223 aa  48.5  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  20 
 
 
238 aa  47.8  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  19.28 
 
 
251 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  24.32 
 
 
242 aa  47  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4304  hypothetical protein  25.63 
 
 
218 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.648821  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  21.76 
 
 
263 aa  46.6  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  23.26 
 
 
223 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  25.54 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  26.07 
 
 
237 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  34.23 
 
 
550 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  25.88 
 
 
243 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  22.33 
 
 
236 aa  45.4  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2073  hypothetical protein  26.26 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  23.16 
 
 
224 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1298  hypothetical protein  23.08 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_520  hypothetical protein  24.62 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0581  hypothetical protein  24.74 
 
 
240 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1596  hypothetical protein  27.05 
 
 
232 aa  41.6  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>