30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0555 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0555  DNA alkylation repair enzyme-like protein  100 
 
 		 240 aa  497  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_520  hypothetical protein  82.63 
 
 		 240 aa  408  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0581  hypothetical protein  82.68 
 
 		 240 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1298  hypothetical protein  52.05 
 
 		 235 aa  229  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4304  hypothetical protein  51.63 
 
 		 218 aa  224  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.648821  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2664  hypothetical protein  46.33 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0836  hypothetical protein  46.95 
 
 		 219 aa  194  9e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1596  hypothetical protein  39.37 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2310  hypothetical protein  37.44 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2073  hypothetical protein  36.89 
 
 		 227 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2734  hypothetical protein  27.27 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000970803  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2978  hypothetical protein  28.27 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000992399  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2986  hypothetical protein  27.75 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000288545  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2946  hypothetical protein  26.7 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2299  hypothetical protein  26.7 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0222691  hitchhiker  5.32762e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2732  hypothetical protein  26.7 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2941  hypothetical protein  26.7 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000572479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2940  hypothetical protein  26.7 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6684100000000001e-56 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2683  hypothetical protein  26.7 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000553491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2660  hypothetical protein  27.23 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113458  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0294  protein of unknown function DUF1061  29.08 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508637  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  28.35 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  23.59 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  25.64 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1553  hypothetical protein  23.56 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  27.21 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3446  hypothetical protein  26.51 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2658  protein of unknown function DUF1061  20.3 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0529  hypothetical protein  23.12 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0164114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  22.34 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>