43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0836 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0836  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  435  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.206706 
 
 
-
 
NC_002936  DET0581  hypothetical protein  48.11 
 
 
240 aa  202  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_520  hypothetical protein  47.64 
 
 
240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4304  hypothetical protein  51.4 
 
 
218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.648821  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0555  DNA alkylation repair enzyme-like protein  46.95 
 
 
240 aa  194  7e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2664  hypothetical protein  50 
 
 
229 aa  189  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1298  hypothetical protein  48.61 
 
 
235 aa  185  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1596  hypothetical protein  44.95 
 
 
232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2310  hypothetical protein  42.52 
 
 
227 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2073  hypothetical protein  43.58 
 
 
227 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2734  hypothetical protein  35.97 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000970803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2683  hypothetical protein  30.11 
 
 
227 aa  94  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000553491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2941  hypothetical protein  30.11 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000572479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2940  hypothetical protein  30.11 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6684100000000001e-56 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2732  hypothetical protein  30.11 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2946  hypothetical protein  32.89 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2978  hypothetical protein  30.65 
 
 
227 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000992399  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2660  hypothetical protein  29.19 
 
 
227 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2299  hypothetical protein  29.83 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0222691  hitchhiker  5.32762e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2986  hypothetical protein  29.57 
 
 
227 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000288545  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1553  hypothetical protein  30.77 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0294  protein of unknown function DUF1061  25.55 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508637  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  28.9 
 
 
233 aa  51.6  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0067  hypothetical protein  26.63 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0529  hypothetical protein  26.02 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0164114  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1043  hypothetical protein  21.67 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3204  hypothetical protein  30.59 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3335  hypothetical protein  23.13 
 
 
229 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.694909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3091  hypothetical protein  23.13 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3313  hypothetical protein  23.13 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3446  hypothetical protein  24.5 
 
 
220 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2988  hypothetical protein  24.55 
 
 
235 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000939837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3298  hypothetical protein  22.45 
 
 
235 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.910615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1969  hypothetical protein  23.64 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.86972 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3305  hypothetical protein  22.45 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3273  hypothetical protein  23.64 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179286  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2658  protein of unknown function DUF1061  23.9 
 
 
236 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3037  hypothetical protein  23.64 
 
 
251 aa  46.2  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.972219  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  27.22 
 
 
225 aa  45.4  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  27.4 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  27.23 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0505  hypothetical protein  42 
 
 
221 aa  42.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.459483  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5568  hypothetical protein  26.13 
 
 
221 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.982925  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>