49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4304 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4304  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  441  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.648821  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_520  hypothetical protein  53.99 
 
 		 240 aa  227  8e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0581  hypothetical protein  52.78 
 
 		 240 aa  225  3e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0555  DNA alkylation repair enzyme-like protein  51.63 
 
 		 240 aa  224  6e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1298  hypothetical protein  53.77 
 
 		 235 aa  224  7e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0836  hypothetical protein  51.4 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206706 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2664  hypothetical protein  48.15 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1596  hypothetical protein  42.99 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2310  hypothetical protein  41.12 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2073  hypothetical protein  41.07 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2660  hypothetical protein  36.14 
 
 		 227 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2946  hypothetical protein  35.54 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2683  hypothetical protein  34.94 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000553491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2940  hypothetical protein  34.94 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6684100000000001e-56 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2734  hypothetical protein  34.94 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000970803  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2941  hypothetical protein  34.94 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000572479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2732  hypothetical protein  34.94 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2299  hypothetical protein  34.34 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0222691  hitchhiker  5.32762e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2978  hypothetical protein  36.14 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000992399  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2986  hypothetical protein  35.54 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000288545  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0294  protein of unknown function DUF1061  28.93 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508637  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2658  protein of unknown function DUF1061  27.38 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3204  hypothetical protein  30.05 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3446  hypothetical protein  27.98 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  28.27 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  27.51 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0067  hypothetical protein  26.77 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0529  hypothetical protein  27.33 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0164114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1553  hypothetical protein  26.79 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  23.04 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0505  hypothetical protein  43.28 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.459483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  25.63 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3386  protein of unknown function DUF1061  24.87 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1043  hypothetical protein  24.04 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  25 
 
 		 261 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5568  hypothetical protein  27.78 
 
 		 221 aa  45.1  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.982925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2175  hypothetical protein  28.02 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.094597  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  26.34 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3313  hypothetical protein  36.21 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3335  hypothetical protein  36.21 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.694909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3091  hypothetical protein  36.21 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104599  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2988  hypothetical protein  31.88 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000939837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3273  hypothetical protein  36.21 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179286  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  24.06 
 
 		 241 aa  42.4  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  26.83 
 
 		 234 aa  42  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1969  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  42  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.86972 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  24.67 
 
 		 237 aa  41.6  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3305  hypothetical protein  23.86 
 
 		 235 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3298  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.910615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>