46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2664 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2664  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  457  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1298  hypothetical protein  48.18 
 
 
235 aa  211  9e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0581  hypothetical protein  44.89 
 
 
240 aa  204  7e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0555  DNA alkylation repair enzyme-like protein  46.33 
 
 
240 aa  203  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_520  hypothetical protein  45 
 
 
240 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0836  hypothetical protein  50 
 
 
219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.206706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4304  hypothetical protein  48.15 
 
 
218 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.648821  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1596  hypothetical protein  41.36 
 
 
232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2310  hypothetical protein  35.87 
 
 
227 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2073  hypothetical protein  39.09 
 
 
227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2734  hypothetical protein  31.16 
 
 
227 aa  88.2  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000970803  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2946  hypothetical protein  29.65 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2299  hypothetical protein  28.64 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0222691  hitchhiker  5.32762e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2941  hypothetical protein  28.93 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000572479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2940  hypothetical protein  28.93 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6684100000000001e-56 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2732  hypothetical protein  28.93 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2978  hypothetical protein  30.46 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000992399  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2683  hypothetical protein  28.93 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000553491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2986  hypothetical protein  28.93 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000288545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2660  hypothetical protein  28.14 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3204  hypothetical protein  26.56 
 
 
227 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1553  hypothetical protein  24.49 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3446  hypothetical protein  24.48 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1455  hypothetical protein  25 
 
 
224 aa  49.3  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000773968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3305  hypothetical protein  20.5 
 
 
235 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0294  protein of unknown function DUF1061  21.83 
 
 
234 aa  48.9  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508637  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  25.76 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0529  hypothetical protein  23.96 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0164114  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0067  hypothetical protein  25.61 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3298  hypothetical protein  20.5 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.910615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2988  hypothetical protein  19.5 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000939837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3313  hypothetical protein  19.5 
 
 
235 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3091  hypothetical protein  19.5 
 
 
235 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104599  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1043  hypothetical protein  22.42 
 
 
235 aa  46.2  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3273  hypothetical protein  21.21 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179286  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3386  protein of unknown function DUF1061  23.26 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5568  hypothetical protein  27.44 
 
 
221 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.982925  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3335  hypothetical protein  20 
 
 
229 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.694909  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1969  hypothetical protein  20.45 
 
 
235 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.86972 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0764  hypothetical protein  22.88 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0471664  normal  0.441546 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  29.47 
 
 
225 aa  42.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  24 
 
 
237 aa  42  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  25 
 
 
234 aa  42  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0317  M49 family peptidase  29.9 
 
 
886 aa  41.6  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.620339 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3037  hypothetical protein  20.45 
 
 
251 aa  42  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.972219  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0909  hypothetical protein  34.41 
 
 
217 aa  41.6  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>