24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0505 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0505  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  457  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.459483  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1553  hypothetical protein  34.74 
 
 
222 aa  96.3  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0909  hypothetical protein  31.37 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3204  hypothetical protein  29.41 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3446  hypothetical protein  29.95 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0529  hypothetical protein  27.45 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0164114  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5568  hypothetical protein  26.87 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.982925  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0067  hypothetical protein  25.96 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2658  protein of unknown function DUF1061  23.67 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2660  hypothetical protein  27.49 
 
 
227 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113458  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4304  hypothetical protein  43.28 
 
 
218 aa  48.9  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.648821  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0294  protein of unknown function DUF1061  23.04 
 
 
234 aa  48.5  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2940  hypothetical protein  26.19 
 
 
227 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6684100000000001e-56 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2941  hypothetical protein  26.19 
 
 
227 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000572479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2732  hypothetical protein  26.19 
 
 
227 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2734  hypothetical protein  26.32 
 
 
227 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000970803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2683  hypothetical protein  26.19 
 
 
227 aa  45.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000553491  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2946  hypothetical protein  26.19 
 
 
227 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2986  hypothetical protein  26.19 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000288545  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_520  hypothetical protein  40.74 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0581  hypothetical protein  42.59 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2299  hypothetical protein  26.19 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0222691  hitchhiker  5.32762e-16 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0836  hypothetical protein  42 
 
 
219 aa  42.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.206706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2978  hypothetical protein  25.73 
 
 
227 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000992399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>