35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1132 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1132  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  449  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110676  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  52.58 
 
 
223 aa  237  9e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  41.36 
 
 
222 aa  193  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2437  DNA-7-methylguanine glycosylase  38.73 
 
 
210 aa  153  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000187196  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1275  DNA alkylation repair protein  43.4 
 
 
172 aa  142  4e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0157146  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3013  DNA-7-methylguanine glycosylase  35.51 
 
 
231 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6988  DNA alkylation repair enzyme  33.63 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25051  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  32.26 
 
 
237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  31.8 
 
 
237 aa  118  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  32.11 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  31.8 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  31.34 
 
 
237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  31.25 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  31.34 
 
 
237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  31.34 
 
 
237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  31.34 
 
 
237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  31.34 
 
 
237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  30.88 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  30.88 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  31.28 
 
 
231 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  31.28 
 
 
231 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  31.28 
 
 
231 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  31.39 
 
 
228 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  29.33 
 
 
234 aa  95.9  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  29.91 
 
 
223 aa  95.1  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  29.76 
 
 
229 aa  95.1  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  26.73 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  25.45 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  22.43 
 
 
225 aa  51.6  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  28.1 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  28.41 
 
 
234 aa  45.1  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  25.69 
 
 
550 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  22.42 
 
 
236 aa  42.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2073  hypothetical protein  26.51 
 
 
227 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  25 
 
 
234 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>