30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1275 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1275  DNA alkylation repair protein  100 
 
 
172 aa  353  6.999999999999999e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0157146  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  52.8 
 
 
222 aa  174  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1132  hypothetical protein  43.4 
 
 
219 aa  142  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110676  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  45.45 
 
 
223 aa  142  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2437  DNA-7-methylguanine glycosylase  42.44 
 
 
210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000187196  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  41.18 
 
 
217 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  40.88 
 
 
223 aa  106  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  42.19 
 
 
228 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  41.61 
 
 
237 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3013  DNA-7-methylguanine glycosylase  37.59 
 
 
231 aa  97.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  40.15 
 
 
237 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  39.04 
 
 
237 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  40.15 
 
 
237 aa  94.7  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  39.04 
 
 
237 aa  94.7  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  39.04 
 
 
237 aa  94.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  39.04 
 
 
237 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  39.04 
 
 
237 aa  94.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  39.42 
 
 
237 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  39.04 
 
 
237 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6988  DNA alkylation repair enzyme  36.43 
 
 
233 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25051  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  36.99 
 
 
231 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  36.99 
 
 
231 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  36.99 
 
 
231 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  38.41 
 
 
237 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  35.11 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  30.77 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  30.59 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  23.24 
 
 
240 aa  44.3  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  26.53 
 
 
261 aa  44.3  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  25 
 
 
250 aa  43.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>