More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3314 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  40.72 
 
 
1141 aa  643    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.21 
 
 
1160 aa  773    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  42.18 
 
 
1110 aa  686    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  43.32 
 
 
1163 aa  770    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  53.69 
 
 
1102 aa  976    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  46.21 
 
 
1143 aa  698    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  41.39 
 
 
1154 aa  766    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  100 
 
 
1096 aa  2149    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  45.1 
 
 
1227 aa  598  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  38.69 
 
 
1081 aa  599  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.52 
 
 
1118 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  47.66 
 
 
1159 aa  541  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  37.6 
 
 
1055 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  37.44 
 
 
1021 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  36.21 
 
 
1086 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.53 
 
 
1261 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  37.64 
 
 
1068 aa  371  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  34.27 
 
 
964 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  34.25 
 
 
1071 aa  366  1e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.3 
 
 
1069 aa  362  1e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  32.74 
 
 
1068 aa  362  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  33.33 
 
 
1250 aa  361  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  38.16 
 
 
1062 aa  360  6e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  36.69 
 
 
1362 aa  359  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  37.28 
 
 
1386 aa  356  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.79 
 
 
1112 aa  356  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.93 
 
 
1091 aa  355  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  33.16 
 
 
1073 aa  353  8e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 
1073 aa  353  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  41.7 
 
 
1449 aa  351  5e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.17 
 
 
982 aa  350  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.16 
 
 
1073 aa  348  3e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.06 
 
 
1068 aa  346  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  32.64 
 
 
1068 aa  346  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.13 
 
 
1171 aa  346  2e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.07 
 
 
1104 aa  345  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  34.24 
 
 
1088 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  36.69 
 
 
1112 aa  345  2.9999999999999997e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  32.9 
 
 
1073 aa  345  4e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  35.06 
 
 
1073 aa  343  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.98 
 
 
1403 aa  343  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  32.25 
 
 
977 aa  342  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  35.15 
 
 
1087 aa  342  2.9999999999999998e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.43 
 
 
1129 aa  341  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  36.95 
 
 
1066 aa  340  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  39.39 
 
 
1120 aa  340  9e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  34.8 
 
 
959 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  32.57 
 
 
1130 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  32.46 
 
 
1077 aa  339  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  32.97 
 
 
1003 aa  338  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  37.29 
 
 
1381 aa  336  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  36.38 
 
 
1084 aa  337  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  35.13 
 
 
1082 aa  336  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  34.47 
 
 
1070 aa  336  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  36.38 
 
 
1084 aa  334  5e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  31.86 
 
 
1125 aa  334  6e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  33.12 
 
 
1080 aa  334  6e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  34.15 
 
 
1127 aa  333  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  45.03 
 
 
991 aa  334  7.000000000000001e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  40.48 
 
 
1357 aa  333  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  39.14 
 
 
1178 aa  333  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  34.41 
 
 
1082 aa  333  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  35.84 
 
 
1088 aa  332  2e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  44.93 
 
 
985 aa  333  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  34.8 
 
 
1082 aa  332  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  35.68 
 
 
1088 aa  330  9e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  37.1 
 
 
1108 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  38 
 
 
777 aa  329  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  38.49 
 
 
1100 aa  329  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  37.24 
 
 
988 aa  327  7e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  43 
 
 
773 aa  327  9e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  33.39 
 
 
918 aa  327  9e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  43.65 
 
 
1025 aa  327  9e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  42.47 
 
 
1209 aa  326  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  41.16 
 
 
1164 aa  326  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  42.6 
 
 
872 aa  326  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  32.95 
 
 
1031 aa  326  2e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  33.22 
 
 
918 aa  325  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  42.22 
 
 
663 aa  326  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.04 
 
 
1139 aa  325  3e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  34.03 
 
 
1066 aa  325  4e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  34.96 
 
 
1354 aa  324  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.8 
 
 
1082 aa  324  5e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  33.22 
 
 
918 aa  323  8e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  33.06 
 
 
918 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  33.06 
 
 
918 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  33.06 
 
 
918 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  33.06 
 
 
918 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.96 
 
 
1113 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  36.96 
 
 
1113 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  33.93 
 
 
1070 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  35.04 
 
 
1102 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  30.11 
 
 
1084 aa  322  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  32.72 
 
 
918 aa  321  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  31.21 
 
 
1064 aa  320  7e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  33.06 
 
 
918 aa  320  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 
1155 aa  320  9e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  32.82 
 
 
1134 aa  320  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 
918 aa  320  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  36.31 
 
 
896 aa  319  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>