More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12700 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12700  shikimate kinase  100 
 
 		 179 aa  362  1e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.947256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0096  Shikimate kinase  72.02 
 
 		 171 aa  251  5.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.650156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3880  shikimate kinase  51.52 
 
 		 170 aa  178  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2255  shikimate kinase  47.62 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1018  shikimate kinase  48.7 
 
 		 170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1850  shikimate kinase  43.48 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2014  shikimate kinase  46.01 
 
 		 169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2437  shikimate kinase  47.71 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00281475  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1256  shikimate kinase  46.9 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0372  shikimate kinase  48.63 
 
 		 167 aa  141  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0374428  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0517  Shikimate kinase  41.67 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3183  shikimate kinase  43.02 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.020728  hitchhiker  0.00306949 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1230  shikimate kinase  41.07 
 
 		 171 aa  131  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0200  shikimate kinase  40.37 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.495734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3097  shikimate kinase  45.33 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0731  shikimate kinase  40.13 
 
 		 170 aa  124  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000355155  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1973  shikimate kinase  37.79 
 
 		 192 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0334894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0183  shikimate kinase  39.75 
 
 		 201 aa  120  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000422214 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0912  shikimate kinase  39.77 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0723  shikimate kinase  35.26 
 
 		 180 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2609  shikimate kinase  37.5 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0706478  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0971  shikimate kinase  39.52 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.488424 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0827  shikimate kinase  42.33 
 
 		 173 aa  111  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2426  shikimate kinase  36.18 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00106596  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0683  shikimate kinase  33.72 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.47245  normal  0.517024 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  37.06 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  34.3 
 
 		 174 aa  100  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  36.69 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0261  shikimate kinase I  35.09 
 
 		 171 aa  98.6  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000154257  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  36.93 
 
 		 173 aa  98.2  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000116276  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  34.91 
 
 		 175 aa  97.8  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  34.91 
 
 		 175 aa  97.8  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3698  shikimate kinase I  35.09 
 
 		 171 aa  97.8  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000225658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0247  shikimate kinase I  35.09 
 
 		 171 aa  97.8  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000294714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4113  shikimate kinase I  35.09 
 
 		 171 aa  97.4  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4084  shikimate kinase I  35.09 
 
 		 171 aa  97.4  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000358948  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4202  shikimate kinase I  35.09 
 
 		 171 aa  97.4  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3894  shikimate kinase I  35.09 
 
 		 171 aa  97.8  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000513438  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4003  shikimate kinase I  35.09 
 
 		 171 aa  97.4  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000558194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3966  shikimate kinase I  36.93 
 
 		 173 aa  97.4  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.60057e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  36.93 
 
 		 173 aa  97.4  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  36.93 
 
 		 173 aa  97.4  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000752096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  33.53 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0286  shikimate kinase I  35.09 
 
 		 171 aa  97.4  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3706  shikimate kinase I  35.09 
 
 		 171 aa  96.7  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000103243  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0213  shikimate kinase I  34.5 
 
 		 171 aa  95.5  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000106831  hitchhiker  0.00783685 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3883  shikimate kinase I  36.36 
 
 		 173 aa  95.5  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3368  shikimate kinase I  34.5 
 
 		 171 aa  95.5  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000011554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  35.88 
 
 		 171 aa  95.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3793  shikimate kinase I  36.36 
 
 		 173 aa  94.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3684  shikimate kinase I  36.36 
 
 		 173 aa  94.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000504262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3855  shikimate kinase I  36.36 
 
 		 173 aa  94.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000716125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3686  shikimate kinase I  36.36 
 
 		 173 aa  94.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3759  shikimate kinase I  36.36 
 
 		 173 aa  94.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00136839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4265  shikimate kinase I  34.5 
 
 		 171 aa  94.4  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00401521  normal  0.220429 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  35.67 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00510  shikimate kinase I  34.5 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0375  shikimate kinase I  35.09 
 
 		 171 aa  94  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00773873  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0238  shikimate kinase I  34.5 
 
 		 171 aa  93.2  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000334252  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  34.34 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03242  shikimate kinase I  36.36 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00034661  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3767  shikimate kinase I  36.36 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106668  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03194  hypothetical protein  36.36 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000404125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0323  shikimate kinase I  36.36 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000129228  normal  0.10404 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3860  shikimate kinase I  36.36 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504187  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3586  shikimate kinase I  36.36 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.9305899999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0323  Shikimate kinase  36.36 
 
 		 225 aa  92  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000263169  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3666  shikimate kinase I  36.36 
 
 		 225 aa  92  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000538429  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3803  shikimate kinase I  36.36 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00268813  normal  0.803666 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  38.57 
 
 		 181 aa  92  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4694  shikimate kinase I  36.36 
 
 		 225 aa  92  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000528588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0340  shikimate kinase I  33.33 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  34.64 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0163  shikimate kinase  33.92 
 
 		 171 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.919882  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0472  shikimate kinase  34.3 
 
 		 172 aa  89.4  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0810879  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2722  shikimate kinase I  33.73 
 
 		 172 aa  89.4  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3036  shikimate kinase  34.13 
 
 		 180 aa  88.6  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  35.37 
 
 		 184 aa  88.6  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0024  shikimate kinase I  35.29 
 
 		 173 aa  88.6  4e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0781  shikimate kinase  35.09 
 
 		 170 aa  89  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.275347  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1113  shikimate kinase  33.76 
 
 		 163 aa  87.8  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0015491  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  36.99 
 
 		 187 aa  87.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  37.14 
 
 		 187 aa  87.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15450  shikimate kinase  34.86 
 
 		 180 aa  86.7  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.801598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  36.05 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  37.66 
 
 		 172 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  35.5 
 
 		 177 aa  87  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2181  Shikimate kinase  35.53 
 
 		 202 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.296368  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  33.57 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  33.73 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  34.52 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  37.66 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1308  shikimate kinase  33.14 
 
 		 172 aa  85.9  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211808 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0660  shikimate kinase  33.13 
 
 		 436 aa  85.1  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.737166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3401  shikimate kinase  36.05 
 
 		 182 aa  85.1  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4010  shikimate kinase I  34.88 
 
 		 196 aa  85.1  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  32.94 
 
 		 182 aa  84.7  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  31.79 
 
 		 180 aa  84.3  8e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  38.51 
 
 		 207 aa  84.3  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0260  Shikimate kinase  35.88 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0179047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>