More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10570 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_10570  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  606  9.999999999999999e-173  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0740  hypothetical protein  41.86 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000338455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.5 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  31.89 
 
 		 641 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3274  putative multidrug efflux system transmembrane protein  31.69 
 
 		 225 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.104011 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  30.99 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  28.07 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  30.23 
 
 		 410 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  28.21 
 
 		 521 aa  72  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  28.02 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  29.19 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.98 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  28.74 
 
 		 407 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.52 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2214  secretion protein HlyD  26.71 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  28.65 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8877  Membrane-fusion protein-like protein  29.05 
 
 		 598 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0841399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4067  RND family efflux transporter MFP subunit  27.43 
 
 		 621 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  27.97 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0218  hypothetical protein  26 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244371  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  29.17 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2466  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.63 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  27.97 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 494 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.82 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2037  secretion protein HlyD  29.61 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.68 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  26.54 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  26.29 
 
 		 621 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 400 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.94 
 
 		 663 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.85 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  25.6 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  25.85 
 
 		 380 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.73 
 
 		 419 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  28.4 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5333  RND family efflux transporter MFP subunit  25.6 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037024 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.47 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3415  secretion protein HlyD  25.6 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.89814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4953  RND family efflux transporter MFP subunit  25.6 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  normal  0.0662922 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.98 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  27.84 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1450  RND family efflux transporter MFP subunit  26.35 
 
 		 622 aa  60.8  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.125039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.17 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  30.18 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.61 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000342468  normal  0.524577 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0836  macrolide efflux protein MacA  25.75 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  30.68 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  25.75 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0927  macrolide efflux protein MacA  25.9 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  27.81 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4832  RND family efflux transporter MFP subunit  29.94 
 
 		 472 aa  59.3  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0873289 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.08 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  28.65 
 
 		 538 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  28.95 
 
 		 449 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  27.08 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  27.08 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  27.08 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  27.08 
 
 		 371 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  29.33 
 
 		 414 aa  59.3  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  27.08 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  29.21 
 
 		 537 aa  58.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  27.08 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  27.08 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  28.74 
 
 		 399 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.21 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.21 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1791  macrolide efflux protein MacA  25.15 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.21 
 
 		 537 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.19 
 
 		 608 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3271  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.41 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.525557  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  24.46 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1700  secretion protein HlyD  26.09 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696744  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1580  RND family efflux transporter MFP subunit  29.93 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186167  normal  0.460313 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.08 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  28.14 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  29.08 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  29.08 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  26.14 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  23.74 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2938  RND family efflux transporter MFP subunit  30.25 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.85 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  29.11 
 
 		 607 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0739  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.52 
 
 		 362 aa  57  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.941037  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.56 
 
 		 505 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  26.39 
 
 		 371 aa  57  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3445  RND family efflux transporter MFP subunit  30.25 
 
 		 401 aa  57  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.655677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  28.97 
 
 		 358 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.38 
 
 		 419 aa  57  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.377405 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  25.83 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  26.97 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.67 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  27.86 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  28.99 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.98 
 
 		 580 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3812  RND family efflux transporter MFP subunit  30.6 
 
 		 498 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.999648  normal  0.340628 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  24.32 
 
 		 415 aa  55.8  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0212  secretion protein HlyD family protein  28.76 
 
 		 536 aa  55.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  25.42 
 
 		 419 aa  55.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>