More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06680 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_06680  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 		 525 aa  1086    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000372543  normal  0.255135 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2145  extracellular solute-binding protein family 5  54.2 
 
 		 537 aa  557  1e-157  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0935  extracellular solute-binding protein family 5  49.62 
 
 		 533 aa  518  1e-146  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1271  ABC transporter, periplasmic binding protein  42.99 
 
 		 528 aa  399  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000259921  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08370  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  44.53 
 
 		 547 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3387  extracellular solute-binding protein family 5  40.67 
 
 		 550 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2471  putative ABC transporter periplasmic binding protein  42.18 
 
 		 530 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0188  extracellular solute-binding protein  41.39 
 
 		 547 aa  372  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  26.36 
 
 		 544 aa  134  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.6 
 
 		 510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  28.06 
 
 		 610 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 528 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 		 528 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1036  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 524 aa  120  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 		 510 aa  120  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 505 aa  117  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  28.3 
 
 		 532 aa  117  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.57 
 
 		 521 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.57 
 
 		 521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.57 
 
 		 521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.57 
 
 		 521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  28.18 
 
 		 514 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0211  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  26.33 
 
 		 544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  29.08 
 
 		 516 aa  114  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1103  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 		 524 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  28.8 
 
 		 506 aa  113  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.45 
 
 		 520 aa  113  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  26.44 
 
 		 532 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  28.13 
 
 		 526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.95 
 
 		 566 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  27.03 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  27.68 
 
 		 512 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  25.37 
 
 		 522 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  25.19 
 
 		 527 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 521 aa  111  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.41 
 
 		 504 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 		 512 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 551 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  26.73 
 
 		 509 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  29.38 
 
 		 502 aa  110  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0255  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 554 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192685  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0028  extracellular solute-binding protein family 5  29.67 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 		 523 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0216  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 553 aa  108  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.923383 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 530 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  30.34 
 
 		 501 aa  107  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 512 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 512 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 512 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 510 aa  107  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 516 aa  106  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  25.91 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  25.91 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  25.62 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.8 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3647  extracellular solute-binding protein family 5  24.24 
 
 		 556 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0862095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  25.91 
 
 		 516 aa  105  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1344  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 506 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.088373  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 516 aa  105  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 541 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  26.76 
 
 		 517 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 		 556 aa  103  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1271  extracellular solute-binding protein family 5  29.72 
 
 		 533 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000259985  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 516 aa  103  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  29.13 
 
 		 527 aa  103  7e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3066  extracellular solute-binding protein family 5  31.65 
 
 		 547 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  23.28 
 
 		 534 aa  103  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  23.12 
 
 		 541 aa  103  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  28.65 
 
 		 522 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0206  extracellular solute-binding protein family 5  28.66 
 
 		 561 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646254  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  25.83 
 
 		 505 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 		 595 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 515 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 538 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  27.19 
 
 		 556 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  25.67 
 
 		 516 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 542 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 		 499 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1556  extracellular solute-binding protein family 5  28.87 
 
 		 525 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3102  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 549 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.522775  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19540  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.95 
 
 		 567 aa  101  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.394832  normal  0.058637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0480  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 569 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105843  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.04 
 
 		 531 aa  101  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26350  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.66 
 
 		 526 aa  100  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3449  extracellular solute-binding protein family 5  34.93 
 
 		 515 aa  100  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.802426 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  28.42 
 
 		 532 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5088  extracellular solute-binding protein family 5  29.15 
 
 		 553 aa  100  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.416607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2203  extracellular solute-binding protein family 5  24.32 
 
 		 531 aa  100  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 532 aa  99.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0232  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 517 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 517 aa  99.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5116  extracellular solute-binding protein family 5  29.06 
 
 		 532 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682235 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  28.88 
 
 		 503 aa  99.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  28.5 
 
 		 532 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 541 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  27.97 
 
 		 528 aa  98.6  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 501 aa  99  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0658  extracellular solute-binding protein family 5  24.96 
 
 		 577 aa  99  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  26.34 
 
 		 541 aa  99  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.76691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>