More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2814 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  63.57 
 
 		 518 aa  694    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  92.91 
 
 		 523 aa  1006    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  68.71 
 
 		 523 aa  767    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  100 
 
 		 523 aa  1071    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  68.33 
 
 		 522 aa  743    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  69.48 
 
 		 523 aa  771    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  70.33 
 
 		 522 aa  764    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  52.09 
 
 		 535 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  52.72 
 
 		 506 aa  500  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  47.21 
 
 		 552 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  51.93 
 
 		 431 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  51.02 
 
 		 442 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  44.07 
 
 		 539 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  51.58 
 
 		 430 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  46.74 
 
 		 429 aa  341  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  45.27 
 
 		 606 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  45.27 
 
 		 606 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  38.59 
 
 		 526 aa  325  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  37.31 
 
 		 519 aa  317  4e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  35.98 
 
 		 522 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  38.32 
 
 		 543 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  35.51 
 
 		 519 aa  306  8.000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  36.59 
 
 		 520 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  41.47 
 
 		 522 aa  303  5.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  35.89 
 
 		 521 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  34.63 
 
 		 526 aa  276  7e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  35.28 
 
 		 553 aa  260  5.0000000000000005e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  36.69 
 
 		 534 aa  253  9.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0420  resolvase domain-containing protein  45.66 
 
 		 342 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000164103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2215  DNA recombinase, putative  55.68 
 
 		 192 aa  217  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  32.76 
 
 		 547 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  34.82 
 
 		 511 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0494  resolvase, N-terminal domain protein  32.44 
 
 		 321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.177718 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  27.24 
 
 		 498 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  29.74 
 
 		 542 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  30.16 
 
 		 542 aa  135  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  30.16 
 
 		 542 aa  135  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  29.31 
 
 		 521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  30.06 
 
 		 535 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2698  hypothetical protein  42.41 
 
 		 194 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  30.61 
 
 		 506 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  27.13 
 
 		 496 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  26.3 
 
 		 475 aa  124  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.39 
 
 		 462 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  26.87 
 
 		 475 aa  120  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  25.93 
 
 		 665 aa  120  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  27.38 
 
 		 479 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  26.45 
 
 		 613 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  27.84 
 
 		 548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.31 
 
 		 522 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  31.76 
 
 		 539 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  24.46 
 
 		 546 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  23.91 
 
 		 515 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.97 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  25.4 
 
 		 537 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  25.93 
 
 		 524 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  24.35 
 
 		 447 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.76 
 
 		 546 aa  107  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  27.78 
 
 		 554 aa  106  8e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  25.63 
 
 		 586 aa  106  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  28.03 
 
 		 542 aa  106  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  26.28 
 
 		 517 aa  106  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  25.93 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  28.11 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.96 
 
 		 494 aa  104  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  27.74 
 
 		 459 aa  104  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  25.68 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  24.38 
 
 		 509 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  31.74 
 
 		 295 aa  101  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  28.28 
 
 		 343 aa  100  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  23.24 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  25.11 
 
 		 500 aa  100  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0737  hypothetical protein  74.19 
 
 		 64 aa  99.8  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00205716 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  25 
 
 		 558 aa  99.8  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  24.17 
 
 		 528 aa  99.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  25.19 
 
 		 537 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  29.09 
 
 		 441 aa  99  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  25.21 
 
 		 527 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  24.28 
 
 		 528 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  24.56 
 
 		 510 aa  97.8  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  27.41 
 
 		 281 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  25.19 
 
 		 534 aa  97.8  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  24.94 
 
 		 534 aa  97.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  26.96 
 
 		 500 aa  97.4  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  24.94 
 
 		 534 aa  97.4  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  27.76 
 
 		 612 aa  97.1  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  24.7 
 
 		 421 aa  97.1  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  24.09 
 
 		 511 aa  96.7  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  28.48 
 
 		 441 aa  96.3  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  24.69 
 
 		 534 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  24.69 
 
 		 534 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  27.07 
 
 		 488 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  24.33 
 
 		 541 aa  95.1  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  24.94 
 
 		 537 aa  95.1  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  24.54 
 
 		 551 aa  95.1  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  24.06 
 
 		 445 aa  95.1  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  24.6 
 
 		 525 aa  94.4  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  24.69 
 
 		 563 aa  94  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  22.84 
 
 		 445 aa  94  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  24.87 
 
 		 544 aa  93.6  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>