More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4788 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4788  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  737    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1957  hypothetical protein  40.69 
 
 		 354 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.654804  normal  0.114361 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2014  hypothetical protein  32.6 
 
 		 352 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2009  hypothetical protein  32.6 
 
 		 352 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1020  hypothetical protein  29.47 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1150  hypothetical membrane spanning protein  29.47 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5234  hypothetical protein  32.77 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0793  hypothetical protein  29.61 
 
 		 348 aa  112  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3345  hypothetical protein  28.42 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3067  hypothetical protein  29.21 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722131  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2996  hypothetical protein  30.4 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.229433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  28.32 
 
 		 353 aa  109  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3659  hypothetical protein  32.4 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0638108 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  30.84 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3864  hypothetical protein  27.92 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285096  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2437  hypothetical protein  30.5 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.705178  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  30.26 
 
 		 372 aa  105  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  28.16 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  29.19 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  29.23 
 
 		 406 aa  103  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  32.31 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  27.87 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  27.93 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  29.32 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  28.91 
 
 		 369 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  28.91 
 
 		 369 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  28.2 
 
 		 359 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  25.47 
 
 		 360 aa  98.6  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  27.44 
 
 		 350 aa  99.4  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  27.91 
 
 		 359 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  26.53 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  27.94 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  27.94 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  27.33 
 
 		 368 aa  97.4  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  28.35 
 
 		 354 aa  96.7  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1044  protein of unknown function UPF0118  26.75 
 
 		 345 aa  96.7  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  27.62 
 
 		 344 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  27.62 
 
 		 344 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  27.62 
 
 		 344 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  27.65 
 
 		 359 aa  96.3  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  27.11 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  26.91 
 
 		 368 aa  95.9  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  27.97 
 
 		 394 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  28.12 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  28.48 
 
 		 368 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  28.48 
 
 		 368 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4059  protein of unknown function UPF0118  25.55 
 
 		 409 aa  93.6  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.793351  normal  0.664479 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  26.88 
 
 		 352 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  26.88 
 
 		 352 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  26.88 
 
 		 352 aa  93.6  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  26.22 
 
 		 336 aa  92.8  8e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  26.16 
 
 		 358 aa  92.8  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1228  hypothetical protein  33.55 
 
 		 338 aa  92.8  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1598  putative transport protein  29.21 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2311  putative transport protein  28.89 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01570  predicted inner membrane protein  28.89 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2042  protein of unknown function UPF0118  28.89 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230614  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1787  putative transport protein  28.89 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.619529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01560  hypothetical protein  28.89 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2029  putative transport protein  28.89 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.854402  normal  0.642454 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1808  putative transport protein  28.89 
 
 		 344 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  28.85 
 
 		 350 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3065  hypothetical protein  25.71 
 
 		 342 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.499692  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23200  predicted permease  28.89 
 
 		 398 aa  90.5  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  27.67 
 
 		 360 aa  90.1  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  25.46 
 
 		 389 aa  90.1  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  25.78 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  25.36 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1675  putative transport protein  28.57 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  25.36 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3357  protein of unknown function UPF0118  27.4 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  23.59 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  25.36 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  25.36 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  25.36 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  25.36 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  25.36 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  25.36 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  25.36 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  26.99 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  24.46 
 
 		 393 aa  87  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  26.55 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3954  inner membrane protein YhhT  26.86 
 
 		 349 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  26.13 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  34.57 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  34.57 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  34.57 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  34.57 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  24.87 
 
 		 663 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2449  hypothetical protein  27.92 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00490145  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0172  hypothetical protein  24.7 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000263309  normal  0.0370984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1524  protein of unknown function UPF0118  29.84 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  25.14 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  26.77 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  23.55 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  22.29 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1983  protein of unknown function UPF0118  25.42 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  24.21 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  27.33 
 
 		 824 aa  79.7  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  20.74 
 
 		 390 aa  79.3  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>