More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2457 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2457  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.325923  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2975  Crp/FNR family transcriptional regulator  59.7 
 
 		 220 aa  245  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.169439  normal  0.307783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4729  transcriptional regulator FixK  44.5 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1361  transcriptional regulator FixK  44.5 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1340  transcriptional regulator FixK  45.41 
 
 		 229 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6107  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 227 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4055  transcriptional regulator FixK  45.9 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2786  transcriptional regulator FixK  44.5 
 
 		 229 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0460697  normal  0.11454 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1746  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.15 
 
 		 236 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.753218  normal  0.546792 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0629  transcriptional regulator FixK  44.44 
 
 		 215 aa  161  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.595222  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.95 
 
 		 230 aa  161  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1036  transcriptional regulator FixK  43.17 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1951  transcriptional regulator FixK  39.9 
 
 		 231 aa  158  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6927  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 227 aa  158  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4375  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3277  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.37 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3812  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.61 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3505  regulatory protein Crp  45.61 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6270  transcriptional regulator FixK  43.43 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.967473  normal  0.128199 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0870  transcriptional regulator FixK  45.12 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4871  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.58 
 
 		 228 aa  144  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0408  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1823  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.07 
 
 		 234 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0333657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2220  transcriptional regulator FixK  41.94 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.552775  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3889  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.17 
 
 		 229 aa  131  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0192  CRP family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0422  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.29 
 
 		 246 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5184  transcriptional regulator FixK  40.74 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3266  cyclic nucleotide-binding  42.94 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5746  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1302  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.72 
 
 		 254 aa  124  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1557  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.3 
 
 		 250 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00717235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6132  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 245 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0884478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1357  cyclic nucleotide-binding  45.06 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.395788 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1945  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 242 aa  118  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2158  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 208 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198273  normal  0.103025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5030  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.34 
 
 		 238 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3926  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.34 
 
 		 238 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4713  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.27 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557049  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658135  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4039  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 239 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191538  hitchhiker  0.00387918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0946  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6164  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.01 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257657  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1357  Crp/Fnr family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 239 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0576  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 235 aa  111  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.670039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.32 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948966  hitchhiker  0.00636029 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1377  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 310 aa  109  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1742  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 242 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_004310  BR0654  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 248 aa  108  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3322  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0702622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1464  transcriptional activator Anr  35.75 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2634  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0647  nitrogen fixation regulation protein fixk  36.67 
 
 		 251 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1678  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.330352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1984  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.79 
 
 		 250 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.312779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2026  transcriptional activator Crp family  34.43 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1752  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40 
 
 		 250 aa  104  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2699  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 232 aa  104  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.276502  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4294  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1811  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 244 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.71 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1991  transcriptional activator Anr  33.33 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4433  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4272  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.36 
 
 		 218 aa  99  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71016  normal  0.563993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3788  transcriptional regulator Anr  34.08 
 
 		 244 aa  99  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44490  transcriptional regulator Anr  34.08 
 
 		 244 aa  99  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1273  cAMP-binding protein  30.85 
 
 		 243 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1111  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.88 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700786  normal  0.531022 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5008  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 249 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1204  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.46 
 
 		 242 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3149  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 249 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1170  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 274 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2233  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0375344  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3425  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  31.79 
 
 		 244 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0460  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 256 aa  95.9  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4486  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 248 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3138  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 248 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7766  nitrogen fixation regulation protein fixK  29.02 
 
 		 235 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4265  transcriptional regulator Anr  33.33 
 
 		 244 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1603  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 403 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3830  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0606  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 267 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3583  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1987  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  29.84 
 
 		 239 aa  95.1  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.58 
 
 		 256 aa  95.1  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2115  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30.64 
 
 		 250 aa  94.7  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.508722  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2014  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30.64 
 
 		 250 aa  94.7  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000422436 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2356  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30.06 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0031  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1184  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1961  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30.64 
 
 		 250 aa  94  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754009 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284481  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7770  putative nitrogen fixation regulation protein fixK  34.44 
 
 		 256 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209002  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0051  cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases  33.33 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1464  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>