More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1929 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  100 
 
 
422 aa  823    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0688  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  47.55 
 
 
398 aa  363  3e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4258  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.95 
 
 
410 aa  352  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04022  bicyclomycin resistance protein  42.65 
 
 
416 aa  332  6e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10238  bicyclomycin resistance protein  42.93 
 
 
406 aa  331  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.34 
 
 
413 aa  329  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3362  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.01 
 
 
405 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  46.36 
 
 
397 aa  297  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4100  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.34 
 
 
414 aa  296  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256573 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.12 
 
 
421 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.45 
 
 
421 aa  280  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.95 
 
 
421 aa  276  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  38.44 
 
 
423 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.1 
 
 
426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  37.88 
 
 
425 aa  273  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.79 
 
 
428 aa  274  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.13 
 
 
405 aa  271  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 
426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.67 
 
 
420 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2134  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.8 
 
 
430 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1106  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.29 
 
 
445 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  39.26 
 
 
414 aa  266  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  40.25 
 
 
405 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.25 
 
 
405 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0246782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  37.88 
 
 
461 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.62 
 
 
430 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  38.22 
 
 
388 aa  259  6e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1501  major facilitator transporter  40.9 
 
 
405 aa  258  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4899  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.69 
 
 
422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.26 
 
 
410 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1935  MFS permease  39.26 
 
 
401 aa  250  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1348  major facilitator transporter  38.29 
 
 
407 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0753  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.56 
 
 
411 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.514561 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1778  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.25 
 
 
404 aa  247  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  34.6 
 
 
437 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.07 
 
 
412 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348648  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.42 
 
 
415 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00164686  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1559  major facilitator superfamily transporter  38.96 
 
 
402 aa  243  6e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.23279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.77 
 
 
401 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.66 
 
 
414 aa  230  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.226188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1272  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40 
 
 
415 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313139  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4830  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.18 
 
 
418 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.65 
 
 
417 aa  218  1e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.61 
 
 
425 aa  216  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1509  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 
397 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.426871 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.89 
 
 
403 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.2 
 
 
398 aa  160  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.8 
 
 
417 aa  159  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3888  major facilitator transporter  29.89 
 
 
394 aa  159  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0648184  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  32.88 
 
 
404 aa  158  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.04 
 
 
399 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  30.87 
 
 
426 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.4 
 
 
393 aa  154  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.58 
 
 
418 aa  153  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.75 
 
 
414 aa  153  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.53 
 
 
399 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.79 
 
 
396 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.95 
 
 
424 aa  149  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.47 
 
 
406 aa  149  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.5 
 
 
411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4430  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 
454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0528088  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.68 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.28 
 
 
414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.57 
 
 
435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000185611  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.65 
 
 
400 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.26 
 
 
415 aa  147  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.3 
 
 
399 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.55 
 
 
399 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.91 
 
 
403 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.97 
 
 
405 aa  147  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.55 
 
 
399 aa  147  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  31.35 
 
 
420 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.69 
 
 
407 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.25 
 
 
440 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3262  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.53 
 
 
414 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.35835  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.14 
 
 
461 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.76 
 
 
436 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.85 
 
 
403 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.95 
 
 
401 aa  144  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.64 
 
 
458 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.18 
 
 
397 aa  143  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3830  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.2 
 
 
413 aa  143  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423466  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.36 
 
 
405 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  30.61 
 
 
392 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  30.61 
 
 
392 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.64 
 
 
405 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.39 
 
 
424 aa  142  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.36 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.64 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.45 
 
 
418 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.98 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.64 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  30.59 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.79 
 
 
412 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.36 
 
 
434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.14 
 
 
398 aa  139  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.67 
 
 
412 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.48 
 
 
425 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.85 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.79 
 
 
402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>