63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1895 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1895  hypothetical protein  100 
 
 		 1025 aa  2089    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  43.46 
 
 		 1557 aa  234  9e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1896  hypothetical protein  45.71 
 
 		 574 aa  212  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  40.86 
 
 		 1933 aa  209  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  37.12 
 
 		 4379 aa  202  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  38.59 
 
 		 2024 aa  199  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1699  hypothetical protein  44.66 
 
 		 593 aa  198  5.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00360282  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  36.98 
 
 		 1838 aa  189  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1722  hypothetical protein  39.47 
 
 		 1013 aa  182  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.919333  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  45.32 
 
 		 1126 aa  112  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  30.13 
 
 		 2461 aa  97.1  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  25.99 
 
 		 4661 aa  87.8  9e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0886  hypothetical protein  26.59 
 
 		 322 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  39.23 
 
 		 2182 aa  80.9  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05355  hypothetical protein  25.96 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0789  hypothetical protein  26.42 
 
 		 320 aa  70.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1424 aa  70.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0730  hypothetical protein  23.88 
 
 		 313 aa  69.7  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4106  hypothetical protein  25.78 
 
 		 346 aa  70.1  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3462  hypothetical protein  26.92 
 
 		 304 aa  70.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.103153  normal  0.128966 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  46.48 
 
 		 3977 aa  64.3  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.83 
 
 		 1180 aa  64.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 3954 aa  62.4  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1479  hypothetical protein  23.26 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35 
 
 		 3427 aa  57  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  28.26 
 
 		 1805 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  37.23 
 
 		 2342 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  37.23 
 
 		 2342 aa  53.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  32.9 
 
 		 1499 aa  52  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  27.78 
 
 		 4798 aa  51.6  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  41.38 
 
 		 1156 aa  51.6  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  34.55 
 
 		 2775 aa  51.2  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  29.11 
 
 		 2950 aa  50.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0533  hemolysin-type calcium-binding region  29.38 
 
 		 359 aa  50.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.695548  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.18 
 
 		 1415 aa  49.3  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  41.3 
 
 		 7284 aa  49.7  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  27.27 
 
 		 1631 aa  49.7  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  32.21 
 
 		 2911 aa  48.9  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  29.71 
 
 		 768 aa  48.9  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  49.23 
 
 		 547 aa  48.5  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  41.77 
 
 		 4106 aa  48.1  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  47.06 
 
 		 5218 aa  47.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 2346 aa  48.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  33.74 
 
 		 3608 aa  47.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0522  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.62 
 
 		 258 aa  47  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0219549  hitchhiker  0.00315047 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  43.66 
 
 		 2807 aa  47  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1526 aa  47  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  39.44 
 
 		 2704 aa  46.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  54.35 
 
 		 1286 aa  46.2  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  31.97 
 
 		 5094 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.25 
 
 		 588 aa  45.8  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01021  hypothetical protein  39.73 
 
 		 595 aa  45.8  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.273299 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3521  hypothetical protein  50 
 
 		 161 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357588  normal  0.598556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  37.89 
 
 		 1287 aa  45.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  34.11 
 
 		 1164 aa  45.4  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2857  hypothetical protein  23.32 
 
 		 326 aa  45.1  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.995543  normal  0.866658 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  60.53 
 
 		 1814 aa  45.4  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  38.04 
 
 		 1883 aa  45.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1937  hypothetical protein  22.36 
 
 		 396 aa  45.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1049  hemolysin-type calcium-binding region  31.29 
 
 		 370 aa  45.1  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.416377  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  35.05 
 
 		 744 aa  45.1  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  67.86 
 
 		 2537 aa  44.7  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  36.56 
 
 		 475 aa  44.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>