29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3462 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3462  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  594  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.103153  normal  0.128966 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05355  hypothetical protein  31.87 
 
 
345 aa  129  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0886  hypothetical protein  26.46 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4106  hypothetical protein  35.23 
 
 
346 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0789  hypothetical protein  30.3 
 
 
320 aa  116  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1479  hypothetical protein  24.47 
 
 
309 aa  108  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0730  hypothetical protein  26.15 
 
 
313 aa  93.2  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2857  hypothetical protein  29.79 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.995543  normal  0.866658 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1895  hypothetical protein  27.86 
 
 
1025 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0382  hypothetical protein  25.64 
 
 
1111 aa  74.7  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3326  hypothetical protein  20.2 
 
 
355 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3028  hypothetical protein  20.2 
 
 
340 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3304  hypothetical protein  20.2 
 
 
355 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3084  hypothetical protein  20.2 
 
 
390 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0722067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1986  hypothetical protein  19.67 
 
 
355 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2989  hypothetical protein  19.54 
 
 
384 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3263  hypothetical protein  19.67 
 
 
355 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3296  hypothetical protein  19.02 
 
 
355 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3287  hypothetical protein  19.02 
 
 
340 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2974  hypothetical protein  19.02 
 
 
390 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0266915  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0836  hypothetical protein  22.8 
 
 
1201 aa  52.8  0.000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0253  hypothetical protein  20.6 
 
 
1206 aa  51.6  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0919  gene transfer agent (GTA) like protein  37.84 
 
 
1286 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3458  gene transfer agent (GTA) orfg15  29.15 
 
 
1297 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384127  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2122  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  24.37 
 
 
1290 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0264351  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0600  hypothetical protein  26.44 
 
 
1287 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1993  gene transfer agent (GTA) orfg15  29.15 
 
 
1283 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.263252  normal  0.679187 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1181  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  35.65 
 
 
1285 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1426  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  31.03 
 
 
1284 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>