15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05355 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_05355  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  722    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0886  hypothetical protein  31.52 
 
 
322 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3462  hypothetical protein  31.73 
 
 
304 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.103153  normal  0.128966 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0789  hypothetical protein  26.34 
 
 
320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4106  hypothetical protein  24.29 
 
 
346 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0730  hypothetical protein  26.74 
 
 
313 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1479  hypothetical protein  25.88 
 
 
309 aa  92.8  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2857  hypothetical protein  24.48 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.995543  normal  0.866658 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1895  hypothetical protein  26.17 
 
 
1025 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0382  hypothetical protein  29.87 
 
 
1111 aa  55.5  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3296  hypothetical protein  21.29 
 
 
355 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2974  hypothetical protein  21.29 
 
 
390 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0266915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3263  hypothetical protein  21.07 
 
 
355 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2989  hypothetical protein  20 
 
 
384 aa  43.1  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11693  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0253  hypothetical protein  30.38 
 
 
1206 aa  42.7  0.01  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>