More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8361 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8361  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 468 aa  920    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  67.54 
 
 		 473 aa  540  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  65.95 
 
 		 475 aa  535  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  62.06 
 
 		 462 aa  528  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4466  DNA repair protein RadA  61.44 
 
 		 468 aa  525  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  62.53 
 
 		 457 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  62.69 
 
 		 454 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  60.94 
 
 		 466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  61.22 
 
 		 457 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0366  DNA repair protein RadA  61.63 
 
 		 462 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  65.34 
 
 		 473 aa  506  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  58.63 
 
 		 472 aa  502  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0968  DNA repair protein RadA  57.59 
 
 		 461 aa  501  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000135308  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01590  DNA repair protein RadA  61.22 
 
 		 478 aa  499  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0397  DNA repair protein RadA  59.87 
 
 		 498 aa  498  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4269  DNA repair protein RadA  60.22 
 
 		 481 aa  489  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35070  DNA repair protein RadA  61.42 
 
 		 454 aa  490  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.773163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4699  DNA repair protein RadA  59.57 
 
 		 499 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24550  DNA repair protein RadA  60.93 
 
 		 461 aa  485  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  62.39 
 
 		 483 aa  482  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  57.14 
 
 		 453 aa  482  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0359  DNA repair protein RadA  58.46 
 
 		 490 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  hitchhiker  0.00589399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4258  DNA repair protein RadA  58.99 
 
 		 485 aa  477  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0645  DNA repair protein RadA  60.13 
 
 		 449 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3279  DNA repair protein RadA  61.61 
 
 		 478 aa  472  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  hitchhiker  0.00533763 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  53.13 
 
 		 467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0150  DNA repair protein RadA  59.68 
 
 		 465 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627247  normal  0.549694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  54.15 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0599  DNA repair protein RadA  57.55 
 
 		 461 aa  457  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.316853  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  56.5 
 
 		 480 aa  442  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0864  DNA repair protein RadA  58.1 
 
 		 475 aa  438  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.493178 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0228  DNA repair protein RadA  54.08 
 
 		 460 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.745621 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5128  DNA repair protein RadA  53.85 
 
 		 466 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.764257 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  49.8 
 
 		 495 aa  429  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4828  DNA repair protein RadA  53.63 
 
 		 466 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4742  DNA repair protein RadA  53.63 
 
 		 466 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1747  DNA repair protein RadA  49.02 
 
 		 512 aa  424  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  49.76 
 
 		 457 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  48.89 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  48.09 
 
 		 448 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  47.02 
 
 		 462 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  46.57 
 
 		 453 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  46.1 
 
 		 454 aa  398  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  49.53 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  47.26 
 
 		 449 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  44.24 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  47.62 
 
 		 476 aa  388  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  41.78 
 
 		 457 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  48.09 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0646  DNA repair protein RadA  49.06 
 
 		 463 aa  388  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  48.33 
 
 		 449 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2008  DNA repair protein RadA  51.18 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480875  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0731  DNA repair protein RadA  49.06 
 
 		 463 aa  388  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  46.12 
 
 		 457 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  48.9 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  47.62 
 
 		 465 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  45.9 
 
 		 477 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  47.87 
 
 		 445 aa  388  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  45.58 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  47.36 
 
 		 447 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0138  DNA repair protein RadA  46.7 
 
 		 475 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.822754  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1574  DNA repair protein RadA  50.94 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2274  DNA repair protein RadA  45.86 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2246  DNA repair protein RadA  46.08 
 
 		 450 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  46.24 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0965  DNA repair protein RadA  49.65 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2602  DNA repair protein RadA  50.94 
 
 		 458 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0200982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  45.9 
 
 		 455 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1358  DNA repair protein RadA  47.58 
 
 		 458 aa  385  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156859  normal  0.874233 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  42.38 
 
 		 451 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  46.74 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1349  DNA repair protein RadA  50.94 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517323  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0500  DNA repair protein RadA  48.55 
 
 		 454 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.81715  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  48.38 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2457  DNA repair protein RadA  50.94 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  45.58 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  46.77 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  48.56 
 
 		 448 aa  385  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2077  DNA repair protein RadA  50.94 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0646051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2513  DNA repair protein RadA  50.94 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3235  DNA repair protein RadA  50.94 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0917  DNA repair protein RadA  50.23 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  45.58 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  43.68 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  45.68 
 
 		 455 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5347  DNA repair protein RadA  50.94 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  45.18 
 
 		 451 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  44.35 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0200  DNA repair protein RadA  49.18 
 
 		 465 aa  381  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  45.91 
 
 		 484 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  45.41 
 
 		 451 aa  382  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  45.58 
 
 		 456 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  46.88 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  43.52 
 
 		 457 aa  375  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  46.8 
 
 		 456 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  44.68 
 
 		 454 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2057  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2038  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  46.62 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1145  DNA repair protein RadA  46.37 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>