More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8342 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8342  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1869  ABC transporter related  75.93 
 
 		 276 aa  311  4.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  74.55 
 
 		 239 aa  306  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  70.64 
 
 		 287 aa  296  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  62.62 
 
 		 235 aa  285  4e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  60.54 
 
 		 230 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  59.29 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  61.16 
 
 		 233 aa  267  8e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  56.19 
 
 		 230 aa  267  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  54.22 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  54.34 
 
 		 226 aa  262  4e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  57.14 
 
 		 224 aa  260  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  56.94 
 
 		 246 aa  260  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  57.99 
 
 		 244 aa  259  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  54.79 
 
 		 240 aa  258  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  56.42 
 
 		 237 aa  258  8e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  55.71 
 
 		 230 aa  257  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  55 
 
 		 225 aa  257  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  56.76 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  56.76 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  54.34 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  60.09 
 
 		 253 aa  255  4e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  60.09 
 
 		 253 aa  254  7e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  54.94 
 
 		 248 aa  254  7e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  51.6 
 
 		 236 aa  254  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  51.38 
 
 		 229 aa  253  3e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  57.27 
 
 		 242 aa  252  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  54.63 
 
 		 231 aa  252  4.0000000000000004e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  55.09 
 
 		 225 aa  251  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  53.67 
 
 		 242 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  54.22 
 
 		 225 aa  250  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  57.46 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  52.73 
 
 		 244 aa  249  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  57.08 
 
 		 291 aa  249  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  54.26 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  63.41 
 
 		 236 aa  248  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  57.35 
 
 		 239 aa  248  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  57.94 
 
 		 658 aa  246  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  53.64 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  53.33 
 
 		 235 aa  245  4e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  58.82 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  52.91 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  55.95 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  59.61 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  54.5 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  56.62 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  53.57 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  59.91 
 
 		 241 aa  242  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  53.21 
 
 		 239 aa  242  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  53.42 
 
 		 249 aa  243  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  54.26 
 
 		 238 aa  243  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  57.92 
 
 		 233 aa  242  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  54.88 
 
 		 233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  52.94 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  59.91 
 
 		 241 aa  241  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  59.91 
 
 		 241 aa  241  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  54.42 
 
 		 255 aa  242  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  53.95 
 
 		 248 aa  241  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  53.95 
 
 		 248 aa  241  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  52.78 
 
 		 226 aa  241  7e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  50.7 
 
 		 228 aa  240  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  53.42 
 
 		 228 aa  240  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  55.41 
 
 		 226 aa  240  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  56.11 
 
 		 234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  56.56 
 
 		 657 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  62.44 
 
 		 254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  57.59 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  52.68 
 
 		 248 aa  238  4e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  53.3 
 
 		 252 aa  238  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  52.56 
 
 		 226 aa  238  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  53.02 
 
 		 226 aa  238  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  52.56 
 
 		 226 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  52.56 
 
 		 226 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  52.56 
 
 		 226 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  52.56 
 
 		 226 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  52.56 
 
 		 226 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  54.42 
 
 		 237 aa  238  6.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1029  ABC transporter related  58.96 
 
 		 276 aa  238  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0752137 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  51.6 
 
 		 228 aa  238  6.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  52.56 
 
 		 226 aa  238  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  51.38 
 
 		 228 aa  237  9e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  56.47 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  59.81 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  59.62 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  53.74 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  53.74 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  52.04 
 
 		 715 aa  237  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  52.31 
 
 		 226 aa  236  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  50.89 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  55.56 
 
 		 291 aa  236  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  51.85 
 
 		 226 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  54.59 
 
 		 241 aa  235  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  50.22 
 
 		 256 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  51.54 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  55.35 
 
 		 241 aa  236  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  55.05 
 
 		 241 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  52.02 
 
 		 254 aa  235  5.0000000000000005e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  53.27 
 
 		 236 aa  234  6e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  53.27 
 
 		 221 aa  234  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  52.7 
 
 		 229 aa  234  6e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>