269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6880 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  100 
 
 
254 aa  507  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  45.83 
 
 
242 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  44 
 
 
152 aa  89.4  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  41.41 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4362  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000726075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  36.43 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  29.91 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  28.29 
 
 
251 aa  65.1  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1418  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
248 aa  62.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  34.68 
 
 
254 aa  62.4  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.19 
 
 
217 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  25.19 
 
 
264 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
244 aa  58.9  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2300  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 
240 aa  58.9  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  24.12 
 
 
244 aa  58.5  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  38.54 
 
 
201 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1051  Methyltransferase type 12  25.57 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235012  normal  0.0241344 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  36.8 
 
 
203 aa  57.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  28.67 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1258  Methyltransferase type 11  26.57 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.760119 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  31.39 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  35.4 
 
 
201 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  26.62 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  23.08 
 
 
233 aa  56.6  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
256 aa  56.6  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  33.9 
 
 
575 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 
209 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  25.47 
 
 
238 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  25.47 
 
 
238 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4547  methyltransferase type 11  30.46 
 
 
254 aa  55.8  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577153  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
252 aa  55.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  21.56 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  22.02 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  22.02 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  22.02 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  22.02 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  22.02 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  22.02 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  30 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3335  Methyltransferase type 12  29.25 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.15309  unclonable  0.0000000176588 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  23.23 
 
 
239 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  22.02 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  21.56 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  32 
 
 
207 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2535  methyltransferase type 12  30.53 
 
 
200 aa  53.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  0.207866 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  25.95 
 
 
276 aa  53.5  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  42 
 
 
219 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.68 
 
 
259 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  25.97 
 
 
252 aa  53.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  31.48 
 
 
247 aa  53.1  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  29.95 
 
 
304 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  24.08 
 
 
251 aa  52.4  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  36 
 
 
200 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2672  LigA  31.37 
 
 
200 aa  52.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  31.58 
 
 
234 aa  52  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  27.18 
 
 
275 aa  52  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  27.89 
 
 
286 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.68 
 
 
251 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.91 
 
 
237 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  34.55 
 
 
214 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  24.24 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3413  Methyltransferase type 12  27.91 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  32.35 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  27.87 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3873  Methyltransferase type 12  33.67 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3350  methyltransferase type 11  29.59 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
201 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  25.56 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  24.81 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
201 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  23.91 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
201 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  27.88 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  33.6 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
237 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
201 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3485  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 
246 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  24.06 
 
 
269 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  32.14 
 
 
423 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  25.87 
 
 
244 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  28.44 
 
 
247 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.01 
 
 
260 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.64 
 
 
229 aa  49.7  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.65 
 
 
258 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  20.09 
 
 
281 aa  49.3  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  38.05 
 
 
267 aa  49.7  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.43 
 
 
258 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  34.21 
 
 
201 aa  49.3  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  27.71 
 
 
231 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  23.2 
 
 
239 aa  48.9  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4368  Methyltransferase type 12  34.21 
 
 
192 aa  48.9  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
201 aa  49.3  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>