More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5126 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5126  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 255 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4608  IclR family transcriptional regulator  72.94 
 
 		 255 aa  363  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7484  IclR family transcriptional regulator  70.98 
 
 		 261 aa  357  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0496  regulatory protein, IclR  71.37 
 
 		 287 aa  357  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3648  transcriptional regulator, IclR family  58.3 
 
 		 263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1022  Transcriptional regulator IclR  56.52 
 
 		 255 aa  248  8e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5039  transcriptional regulator, IclR family  54.8 
 
 		 250 aa  224  9e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5303  transcriptional regulator, IclR family  51.39 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1099  transcriptional regulator, IclR family  47.41 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  37.6 
 
 		 265 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  36.55 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  32.94 
 
 		 259 aa  122  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 254 aa  121  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 267 aa  119  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  31.06 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  36.47 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  32.53 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  31.5 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 252 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.88 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  32.62 
 
 		 252 aa  112  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  37.39 
 
 		 277 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 255 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30.12 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  31.45 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  36.65 
 
 		 266 aa  109  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  36.65 
 
 		 266 aa  109  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.59 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  35.91 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  35.06 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  29.96 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  34.25 
 
 		 273 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  34.66 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  31.8 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  31.8 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  29.01 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  32.74 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 		 253 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  34.3 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  35.32 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  32.3 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  28.85 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  36.73 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  32.74 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  32.74 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  32.74 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  32.74 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  32.74 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  32.74 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  29.25 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  32.74 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  32.74 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  29.77 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  30.3 
 
 		 273 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3937  transcriptional regulator, IclR family  34.67 
 
 		 267 aa  99.8  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.793317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  34.13 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  32.74 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  30.14 
 
 		 265 aa  99.4  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4432  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 271 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  36.16 
 
 		 266 aa  98.6  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 263 aa  98.6  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 292 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  30.19 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  32.74 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  34 
 
 		 279 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  31.84 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  33.93 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  30.59 
 
 		 280 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  30.59 
 
 		 280 aa  96.7  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  33.2 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>