183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4148 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  100 
 
 
788 aa  1543    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  92.86 
 
 
710 aa  885    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1270  Ig family protein  88.86 
 
 
753 aa  518  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902068  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  58.45 
 
 
672 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  70.18 
 
 
884 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  44.68 
 
 
592 aa  320  7e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1967  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50 
 
 
416 aa  318  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0418  protease-like protein  52.02 
 
 
413 aa  315  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.971543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  50.79 
 
 
682 aa  303  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4712  serine protease  49.35 
 
 
429 aa  296  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3631  serine protease  49.86 
 
 
381 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523915  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  47.12 
 
 
1407 aa  273  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6111  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.02 
 
 
423 aa  253  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0242933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0446  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.26 
 
 
412 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2539  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.28 
 
 
434 aa  247  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6937  hydrolase  63.16 
 
 
504 aa  211  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000451446  normal  0.0387498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  42.41 
 
 
918 aa  204  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0444  Ricin B lectin  45.63 
 
 
586 aa  193  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828213  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  56.41 
 
 
663 aa  187  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2169  putative lipoprotein  40.05 
 
 
383 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2163  serine protease  37.75 
 
 
406 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0313892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3113  hypothetical protein  37.75 
 
 
406 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0748  serine protease  37.75 
 
 
406 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2582  serine protease  37.75 
 
 
406 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3032  putative lipoprotein  37.75 
 
 
406 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.924018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3086  putative lipoprotein  37.75 
 
 
406 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2032  putative lipoprotein  37.75 
 
 
406 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0804  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.46 
 
 
403 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.38 
 
 
403 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0945  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.38 
 
 
403 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  43.7 
 
 
1243 aa  170  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1519  serine protease  36.62 
 
 
406 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000201764  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0814  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.18 
 
 
403 aa  168  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0907  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.16 
 
 
405 aa  164  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  44.36 
 
 
691 aa  161  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6381  hypothetical protein  35.93 
 
 
410 aa  158  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6083  hypothetical protein  35.93 
 
 
404 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.805208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  61.93 
 
 
1148 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  50 
 
 
494 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3662  Ig family protein  30.76 
 
 
797 aa  138  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413571  normal  0.157157 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  53.98 
 
 
3244 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3227  protease-like protein  38.38 
 
 
446 aa  127  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000167214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.03 
 
 
651 aa  124  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.311143  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  54.24 
 
 
2079 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1577  protease-like  36.12 
 
 
511 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3141  physarolisin II  32.18 
 
 
672 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  61.67 
 
 
824 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0759  Peptidase S53 propeptide  31.89 
 
 
553 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0323007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  46.93 
 
 
1779 aa  108  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0247  Peptidase S53 propeptide  30.95 
 
 
534 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0136  Ig family protein  40.34 
 
 
622 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  62.86 
 
 
674 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3792  pseudomonalisin  37.94 
 
 
611 aa  99  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04030  subtilisin-like serine protease  40.27 
 
 
641 aa  97.8  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2199  pseudomonalisin  38.34 
 
 
610 aa  97.8  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1071  Peptidase S53 propeptide  32.31 
 
 
507 aa  96.7  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0139548  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1568  serine protease, kumamolysin  30.67 
 
 
524 aa  97.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  27.73 
 
 
976 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4475  pseudomonalisin  37.15 
 
 
610 aa  97.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3272  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.79 
 
 
534 aa  97.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3891  pseudomonalisin  37.15 
 
 
610 aa  97.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3636  pseudomonalisin  37.15 
 
 
610 aa  97.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1994  kumamolisin  32.69 
 
 
519 aa  95.5  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0343845 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1326  Peptidase S53 propeptide  29.23 
 
 
540 aa  95.1  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4778  Peptidase S53 propeptide  32.69 
 
 
519 aa  94.7  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0280801  hitchhiker  0.00223617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  33.33 
 
 
788 aa  94.7  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  60.38 
 
 
815 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2888  Peptidase S53 propeptide  31.01 
 
 
531 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322631  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0859  serine protease  32.17 
 
 
527 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444174  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2116  kumamolisin  31.38 
 
 
529 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  60.4 
 
 
1016 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1369  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.21 
 
 
1271 aa  92.4  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.255631  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3008  Peptidase S53 propeptide  27.5 
 
 
540 aa  91.7  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0361  Peptidase S53 propeptide  28.88 
 
 
1308 aa  91.7  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0637543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5658  Ricin B lectin  56.99 
 
 
840 aa  90.9  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0608  kumamolisin  31.12 
 
 
577 aa  90.1  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0811  serine protease, kumamolysin  31.69 
 
 
622 aa  90.5  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566172  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0705  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.02 
 
 
1072 aa  90.1  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.276754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.41 
 
 
583 aa  90.5  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0811  sedolisin  29.47 
 
 
582 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70323  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0646  serine protease  29.21 
 
 
562 aa  89.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2034  serine protease, kumamolysin  30.85 
 
 
529 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2202  serine protease, kumamolysin  31.12 
 
 
529 aa  89.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566013  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2497  sedolisin  29.43 
 
 
562 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2358  sedolisin  29.43 
 
 
562 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0713  serine protease, kumamolysin  30.85 
 
 
529 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3441  peptidase S53 propeptide  31.88 
 
 
529 aa  89.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4988  peptidase S53 propeptide  31.06 
 
 
529 aa  89  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21910  subtilisin-like serine protease  35.17 
 
 
586 aa  87.8  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.164253  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  67.86 
 
 
688 aa  85.5  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  65.93 
 
 
726 aa  84.7  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.52 
 
 
529 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.52 
 
 
529 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528674  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5054  peptidase S53 propeptide  31.3 
 
 
519 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.813199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.33 
 
 
474 aa  83.2  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2911  Peptidase S53 propeptide  27.35 
 
 
1077 aa  82  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.69 
 
 
538 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  34.07 
 
 
777 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8798  Peptidase S53 propeptide  28.38 
 
 
610 aa  81.6  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424248  normal  0.572713 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4640  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.15 
 
 
529 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>