174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3455 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3455  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 377 aa  763    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.36612  hitchhiker  0.000000549175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3865  hypothetical protein  29.74 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1620  hypothetical protein  30.16 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2431  hypothetical protein  29.03 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000928736  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  26.11 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  24.89 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  26.78 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  25.9 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0509  L,L-diaminopimelate aminotransferase  22.69 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0494  L,L-diaminopimelate aminotransferase  22.69 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  29.19 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  25.66 
 
 		 388 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  25 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  23.05 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1417  aminotransferase, class I and II  24.91 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  25 
 
 		 383 aa  53.1  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  27.48 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3621  hypothetical protein  27.66 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  27.24 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  26.58 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  22.17 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2513  aminotransferase  25.84 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0124388  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  23.81 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  22.03 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  22.17 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2354  L,L-diaminopimelate aminotransferase  27.12 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  24.45 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  22.87 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  25.17 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  24.58 
 
 		 391 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1540  aminotransferase class I and II  26.22 
 
 		 385 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0311  L,L-diaminopimelate aminotransferase  29.27 
 
 		 408 aa  50.1  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  21.89 
 
 		 396 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  21.89 
 
 		 396 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  22.61 
 
 		 398 aa  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1645  threonine-phosphate decarboxylase  24.67 
 
 		 335 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26807  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0853  L,L-diaminopimelate aminotransferase  25.47 
 
 		 411 aa  49.7  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217772  hitchhiker  0.00920973 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0420  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.97 
 
 		 356 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  21.89 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  21.89 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3677  threonine-phosphate decarboxylase  29.08 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405143  normal  0.0339835 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  23.13 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  21.89 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  31.58 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4052  L,L-diaminopimelate aminotransferase  31.25 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  24.21 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  23.83 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  23.88 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  21.89 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  21.67 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1136  aspartate aminotransferase  25.93 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.358682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1477  histidinol-phosphate aminotransferase  24.15 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0994  aspartate aminotransferase  25.93 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0162  L,L-diaminopimelate aminotransferase  21.93 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0789  aminotransferase  27.96 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  23 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  25.75 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1424  LL-diaminopimelate aminotransferase  22.31 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  22 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  25 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0084  hypothetical protein  24.68 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.928121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  21.89 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  24.53 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  33.67 
 
 		 405 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0391  aminotransferase, class I and II  28.72 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4142  L,L-diaminopimelate aminotransferase  31.25 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2238  aminotransferase class I and II  21.03 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  25 
 
 		 388 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2015  histidinol-phosphate aminotransferase  22.16 
 
 		 373 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.788991  normal  0.413564 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  27.45 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  24.82 
 
 		 381 aa  47.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  22.84 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  25.43 
 
 		 395 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  24.32 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  23.66 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  24.01 
 
 		 383 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  19.4 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1712  cobalamin biosynthesis protein CobC  26.81 
 
 		 334 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1744  aminotransferase class I and II  25.52 
 
 		 333 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  22.39 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.56 
 
 		 496 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2610  aminotransferase class I and II  25 
 
 		 399 aa  47  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.63591e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1558  aminotransferase class I and II  22.19 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0317788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4424  L,L-diaminopimelate aminotransferase  31.75 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0886982 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.34 
 
 		 498 aa  47  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  21.88 
 
 		 393 aa  47  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  25.55 
 
 		 384 aa  47  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0914  L-aspartate aminotransferase  26.42 
 
 		 332 aa  47  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  23.29 
 
 		 517 aa  46.6  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  27.15 
 
 		 387 aa  46.6  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  21.33 
 
 		 396 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  25.62 
 
 		 386 aa  46.6  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1754  threonine-phosphate decarboxylase  26.4 
 
 		 336 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0238  L,L-diaminopimelate aminotransferase  26.25 
 
 		 410 aa  46.6  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  22.35 
 
 		 370 aa  46.2  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0615  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.29 
 
 		 491 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  32.18 
 
 		 408 aa  46.2  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2622  cobalamin biosynthetic protein  25.19 
 
 		 337 aa  46.6  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228702  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23741  L,L-diaminopimelate aminotransferase  28.05 
 
 		 417 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113284 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2271  aspartate aminotransferase  19.23 
 
 		 398 aa  46.2  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.738688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>