More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0162 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0162  L,L-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 
410 aa  843    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4052  L,L-diaminopimelate aminotransferase  85.37 
 
 
411 aa  746    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2423  L,L-diaminopimelate aminotransferase  81.17 
 
 
410 aa  707    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0213  L,L-diaminopimelate aminotransferase  96.59 
 
 
410 aa  817    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0427359  hitchhiker  0.00000000000342652 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4142  L,L-diaminopimelate aminotransferase  85.37 
 
 
411 aa  746    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0238  L,L-diaminopimelate aminotransferase  92.93 
 
 
410 aa  790    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3040  L,L-diaminopimelate aminotransferase  91.95 
 
 
410 aa  787    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3061  L,L-diaminopimelate aminotransferase  90.24 
 
 
410 aa  775    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371159  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3995  aminotransferase class I and II  64.13 
 
 
411 aa  568  1e-161  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3101  L,L-diaminopimelate aminotransferase  65.61 
 
 
410 aa  566  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4564  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.99 
 
 
411 aa  558  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273776  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0853  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.88 
 
 
411 aa  553  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217772  hitchhiker  0.00920973 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2324  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.59 
 
 
409 aa  552  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2354  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.44 
 
 
411 aa  548  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4059  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.33 
 
 
411 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4424  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.84 
 
 
411 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0886982 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3293  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.93 
 
 
411 aa  545  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.792404  decreased coverage  0.00697344 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1424  LL-diaminopimelate aminotransferase  61.71 
 
 
411 aa  540  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0494  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.96 
 
 
411 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0509  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.96 
 
 
411 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.93 
 
 
408 aa  530  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16911  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.99 
 
 
408 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0311  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.33 
 
 
408 aa  523  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.74 
 
 
408 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.118927  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1592  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.74 
 
 
408 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.518523  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16801  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60 
 
 
408 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1185  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.8 
 
 
531 aa  517  1.0000000000000001e-145  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1066  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.44 
 
 
408 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1014  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.18 
 
 
409 aa  513  1e-144  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19411  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.44 
 
 
408 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23741  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.62 
 
 
417 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0631  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.71 
 
 
404 aa  503  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.923394  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1351  L,L-diaminopimelate aminotransferase  56.97 
 
 
407 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0206949  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4620  L,L-diaminopimelate aminotransferase  56.83 
 
 
407 aa  491  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0704  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.29 
 
 
407 aa  488  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167221  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16221  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.75 
 
 
408 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.516745  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2779  L,L-diaminopimelate aminotransferase  55.31 
 
 
409 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0363182  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1151  aminotransferase class I and II  53.32 
 
 
408 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00770  LL-diaminopimelate aminotransferase  49.39 
 
 
424 aa  404  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.386201  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22909  predicted protein  46.84 
 
 
443 aa  338  9e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30412  predicted protein  43.95 
 
 
402 aa  332  6e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00618284  normal  0.581125 
 
 
-
 
NC_002620  TC0669  L,L-diaminopimelate aminotransferase  41.13 
 
 
393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  32.43 
 
 
386 aa  169  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.58 
 
 
387 aa  161  3e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  30.36 
 
 
388 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.57 
 
 
390 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.61 
 
 
391 aa  142  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.25 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.17 
 
 
391 aa  139  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.56 
 
 
392 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.78 
 
 
389 aa  136  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  29.35 
 
 
401 aa  136  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  29.55 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  28.29 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  30.47 
 
 
388 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  29.53 
 
 
399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.79 
 
 
388 aa  133  6e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.37 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.34 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  28.54 
 
 
400 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  28.68 
 
 
390 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  31.19 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.6 
 
 
389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.36 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  27.41 
 
 
399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  28.99 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  28.53 
 
 
399 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  28.29 
 
 
400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  27.79 
 
 
399 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  29.78 
 
 
382 aa  126  9e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  29.43 
 
 
382 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  28.04 
 
 
399 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  27.79 
 
 
399 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  28.04 
 
 
400 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  29.85 
 
 
392 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  27.79 
 
 
399 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  28.04 
 
 
399 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  29.92 
 
 
395 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  28.5 
 
 
387 aa  122  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  28.71 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  26.68 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0516  aminotransferase, class I and II  29.27 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.883743  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0644  aminotransferase  27.71 
 
 
402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439805  normal  0.145502 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  27.93 
 
 
384 aa  120  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  28.76 
 
 
394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  28.31 
 
 
396 aa  120  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  29.4 
 
 
382 aa  119  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.3 
 
 
390 aa  119  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  27.95 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  26.73 
 
 
392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  28.8 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  28.26 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  28.54 
 
 
384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  26.49 
 
 
392 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  27.91 
 
 
406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  27.91 
 
 
406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07380  aminotransferase  25.5 
 
 
385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  27.09 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  27.39 
 
 
403 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  26.3 
 
 
391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>