More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0311 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1066  L,L-diaminopimelate aminotransferase  75.49 
 
 		 408 aa  654    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2354  L,L-diaminopimelate aminotransferase  74.07 
 
 		 411 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  89.95 
 
 		 408 aa  765    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0311  L,L-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 408 aa  835    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4059  L,L-diaminopimelate aminotransferase  73.83 
 
 		 411 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0853  L,L-diaminopimelate aminotransferase  76.41 
 
 		 411 aa  655    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217772  hitchhiker  0.00920973 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19411  L,L-diaminopimelate aminotransferase  75.49 
 
 		 408 aa  654    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23741  L,L-diaminopimelate aminotransferase  84.8 
 
 		 417 aa  728    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113284 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1424  LL-diaminopimelate aminotransferase  74.57 
 
 		 411 aa  640    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16221  L,L-diaminopimelate aminotransferase  75.25 
 
 		 408 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.516745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4424  L,L-diaminopimelate aminotransferase  72.91 
 
 		 411 aa  628  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0886982 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3293  L,L-diaminopimelate aminotransferase  73.33 
 
 		 411 aa  629  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.792404  decreased coverage  0.00697344 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0494  L,L-diaminopimelate aminotransferase  72.48 
 
 		 411 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0509  L,L-diaminopimelate aminotransferase  72.48 
 
 		 411 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  69.63 
 
 		 408 aa  607  1e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.118927  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1592  L,L-diaminopimelate aminotransferase  69.88 
 
 		 408 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.518523  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16911  L,L-diaminopimelate aminotransferase  70.12 
 
 		 408 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16801  L,L-diaminopimelate aminotransferase  69.63 
 
 		 408 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3995  aminotransferase class I and II  68.64 
 
 		 411 aa  593  1e-168  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1351  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.79 
 
 		 407 aa  546  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1185  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.44 
 
 		 531 aa  543  1e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2423  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.81 
 
 		 410 aa  532  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4142  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.33 
 
 		 411 aa  530  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4052  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.33 
 
 		 411 aa  528  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0238  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.33 
 
 		 410 aa  526  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3061  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.58 
 
 		 410 aa  525  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371159  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0162  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.33 
 
 		 410 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0704  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.99 
 
 		 407 aa  523  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0213  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.08 
 
 		 410 aa  520  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0427359  hitchhiker  0.00000000000342652 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3040  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.1 
 
 		 410 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4620  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.99 
 
 		 407 aa  514  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3101  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.07 
 
 		 410 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2324  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.62 
 
 		 409 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4564  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.82 
 
 		 411 aa  501  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273776  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2779  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.27 
 
 		 409 aa  497  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0363182  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1014  L,L-diaminopimelate aminotransferase  56.62 
 
 		 409 aa  485  1e-136  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1151  aminotransferase class I and II  53.68 
 
 		 408 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0631  L,L-diaminopimelate aminotransferase  54.28 
 
 		 404 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.923394  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00770  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.37 
 
 		 424 aa  398  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.386201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30412  predicted protein  48.51 
 
 		 402 aa  360  3e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00618284  normal  0.581125 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22909  predicted protein  47.32 
 
 		 443 aa  336  3.9999999999999995e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0669  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40.59 
 
 		 393 aa  280  2e-74  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.92 
 
 		 390 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.17 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  31 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  30.29 
 
 		 388 aa  146  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.53 
 
 		 391 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  31.5 
 
 		 390 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.1 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.79 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  31.42 
 
 		 395 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.44 
 
 		 388 aa  142  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.94 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  30.4 
 
 		 391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  30.02 
 
 		 401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.2 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  28.39 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.13 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.18 
 
 		 389 aa  126  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  27.79 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.63 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.02 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  28.01 
 
 		 392 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  28.25 
 
 		 390 aa  123  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  29.32 
 
 		 392 aa  123  8e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  29.24 
 
 		 382 aa  122  8e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  28.68 
 
 		 392 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  28.68 
 
 		 392 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  28.68 
 
 		 392 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  28.68 
 
 		 392 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  28 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  28.68 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.5 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  28.17 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  29.82 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  27.79 
 
 		 392 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  28.42 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  27.53 
 
 		 392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  29.4 
 
 		 384 aa  120  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  27.34 
 
 		 389 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  29.09 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  27.92 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  27.66 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  27.64 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  27.92 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  27.92 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  27.92 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  27.92 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  27.92 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  27.09 
 
 		 385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  28.76 
 
 		 382 aa  116  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  30.13 
 
 		 393 aa  116  6e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  29.02 
 
 		 392 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.11 
 
 		 390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  27.66 
 
 		 412 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  27.66 
 
 		 412 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  27.66 
 
 		 412 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  27.66 
 
 		 412 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  27.66 
 
 		 412 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  26.46 
 
 		 411 aa  116  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>