More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3061 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0162  L,L-diaminopimelate aminotransferase  90.24 
 
 		 410 aa  775    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0238  L,L-diaminopimelate aminotransferase  89.51 
 
 		 410 aa  767    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3040  L,L-diaminopimelate aminotransferase  87.07 
 
 		 410 aa  753    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2423  L,L-diaminopimelate aminotransferase  79.46 
 
 		 410 aa  702    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0213  L,L-diaminopimelate aminotransferase  90.24 
 
 		 410 aa  775    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0427359  hitchhiker  0.00000000000342652 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4052  L,L-diaminopimelate aminotransferase  81.95 
 
 		 411 aa  723    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4142  L,L-diaminopimelate aminotransferase  81.95 
 
 		 411 aa  725    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3061  L,L-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 410 aa  841    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371159  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3995  aminotransferase class I and II  64.86 
 
 		 411 aa  575  1.0000000000000001e-163  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3101  L,L-diaminopimelate aminotransferase  66.34 
 
 		 410 aa  571  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0853  L,L-diaminopimelate aminotransferase  65.11 
 
 		 411 aa  565  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217772  hitchhiker  0.00920973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4564  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.75 
 
 		 411 aa  558  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273776  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4059  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.33 
 
 		 411 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2354  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.2 
 
 		 411 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4424  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.81 
 
 		 411 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0886982 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2324  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.86 
 
 		 409 aa  548  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1424  LL-diaminopimelate aminotransferase  61.71 
 
 		 411 aa  546  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3293  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.2 
 
 		 411 aa  545  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.792404  decreased coverage  0.00697344 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0494  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.2 
 
 		 411 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0509  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.2 
 
 		 411 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.18 
 
 		 408 aa  530  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16911  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60 
 
 		 408 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60 
 
 		 408 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.118927  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0311  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.58 
 
 		 408 aa  525  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1592  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.25 
 
 		 408 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.518523  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1185  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.27 
 
 		 531 aa  526  1e-148  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16801  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.52 
 
 		 408 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0631  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.71 
 
 		 404 aa  508  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.923394  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1066  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.46 
 
 		 408 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19411  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.71 
 
 		 408 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1014  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.46 
 
 		 409 aa  510  1e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23741  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.13 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113284 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1351  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.95 
 
 		 407 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4620  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.56 
 
 		 407 aa  495  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0704  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.05 
 
 		 407 aa  490  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167221  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16221  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.52 
 
 		 408 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.516745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1151  aminotransferase class I and II  54.05 
 
 		 408 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2779  L,L-diaminopimelate aminotransferase  55.06 
 
 		 409 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0363182  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00770  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.66 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.386201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30412  predicted protein  44.44 
 
 		 402 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00618284  normal  0.581125 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22909  predicted protein  46.12 
 
 		 443 aa  333  4e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0669  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40.15 
 
 		 393 aa  300  2e-80  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 386 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  31.49 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.67 
 
 		 390 aa  156  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.85 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.61 
 
 		 391 aa  145  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.42 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.78 
 
 		 389 aa  142  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  29.55 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.86 
 
 		 392 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.46 
 
 		 388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  29.9 
 
 		 390 aa  133  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.93 
 
 		 389 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  28.61 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  29.84 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.69 
 
 		 391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  29.52 
 
 		 399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  31.19 
 
 		 389 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  28.33 
 
 		 382 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0644  aminotransferase  29.31 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439805  normal  0.145502 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  27.3 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  29.43 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  28.64 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.43 
 
 		 385 aa  126  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  28.78 
 
 		 384 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  28.75 
 
 		 395 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  27.11 
 
 		 401 aa  126  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  28.01 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.12 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  27.53 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.1 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  27.53 
 
 		 392 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0516  aminotransferase, class I and II  29.43 
 
 		 381 aa  123  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.883743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.27 
 
 		 385 aa  123  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  29.06 
 
 		 382 aa  123  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  28.25 
 
 		 400 aa  123  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  27.75 
 
 		 399 aa  123  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  28.64 
 
 		 382 aa  123  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.3 
 
 		 390 aa  123  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  27.94 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  28.25 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  28.16 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07380  aminotransferase  25.73 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  29.6 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  29.76 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  27.72 
 
 		 389 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  27.94 
 
 		 399 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  27.94 
 
 		 400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  27.27 
 
 		 392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  27.94 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  28.01 
 
 		 407 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  27.51 
 
 		 403 aa  119  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  27.65 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  27.94 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  27.65 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.63 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2782  aminotransferase  27.39 
 
 		 406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  27.09 
 
 		 392 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  27.65 
 
 		 406 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>