More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1151 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1151  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 408 aa  842    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1014  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.44 
 
 		 409 aa  529  1e-149  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3101  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.56 
 
 		 410 aa  525  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1351  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.87 
 
 		 407 aa  512  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4564  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.31 
 
 		 411 aa  510  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2324  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.74 
 
 		 409 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0631  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.21 
 
 		 404 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.923394  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3995  aminotransferase class I and II  55.39 
 
 		 411 aa  489  1e-137  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2354  L,L-diaminopimelate aminotransferase  54.81 
 
 		 411 aa  488  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4620  L,L-diaminopimelate aminotransferase  56.19 
 
 		 407 aa  485  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1424  LL-diaminopimelate aminotransferase  55.06 
 
 		 411 aa  486  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4059  L,L-diaminopimelate aminotransferase  55.06 
 
 		 411 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0494  L,L-diaminopimelate aminotransferase  55.04 
 
 		 411 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0509  L,L-diaminopimelate aminotransferase  55.04 
 
 		 411 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23741  L,L-diaminopimelate aminotransferase  56.05 
 
 		 417 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113284 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0704  L,L-diaminopimelate aminotransferase  55.53 
 
 		 407 aa  481  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167221  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4424  L,L-diaminopimelate aminotransferase  55.42 
 
 		 411 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0886982 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2779  L,L-diaminopimelate aminotransferase  55.45 
 
 		 409 aa  476  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0363182  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3293  L,L-diaminopimelate aminotransferase  54.57 
 
 		 411 aa  478  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.792404  decreased coverage  0.00697344 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  54.17 
 
 		 408 aa  474  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0853  L,L-diaminopimelate aminotransferase  55.04 
 
 		 411 aa  474  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217772  hitchhiker  0.00920973 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0238  L,L-diaminopimelate aminotransferase  55.53 
 
 		 410 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16801  L,L-diaminopimelate aminotransferase  52.21 
 
 		 408 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2423  L,L-diaminopimelate aminotransferase  55.28 
 
 		 410 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0311  L,L-diaminopimelate aminotransferase  53.68 
 
 		 408 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  51.6 
 
 		 408 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.118927  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1592  L,L-diaminopimelate aminotransferase  52.35 
 
 		 408 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.518523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3061  L,L-diaminopimelate aminotransferase  54.05 
 
 		 410 aa  461  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371159  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16911  L,L-diaminopimelate aminotransferase  51.85 
 
 		 408 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4142  L,L-diaminopimelate aminotransferase  52.83 
 
 		 411 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4052  L,L-diaminopimelate aminotransferase  53.56 
 
 		 411 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19411  L,L-diaminopimelate aminotransferase  51.46 
 
 		 408 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3040  L,L-diaminopimelate aminotransferase  52.83 
 
 		 410 aa  455  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0162  L,L-diaminopimelate aminotransferase  53.32 
 
 		 410 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1066  L,L-diaminopimelate aminotransferase  51.22 
 
 		 408 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0213  L,L-diaminopimelate aminotransferase  52.58 
 
 		 410 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0427359  hitchhiker  0.00000000000342652 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1185  L,L-diaminopimelate aminotransferase  51.95 
 
 		 531 aa  449  1e-125  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16221  L,L-diaminopimelate aminotransferase  52.7 
 
 		 408 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.516745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00770  LL-diaminopimelate aminotransferase  49.27 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.386201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30412  predicted protein  43.03 
 
 		 402 aa  330  4e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00618284  normal  0.581125 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22909  predicted protein  42.75 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0669  L,L-diaminopimelate aminotransferase  39.21 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.66 
 
 		 388 aa  172  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.75 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  29.76 
 
 		 390 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  30.83 
 
 		 390 aa  162  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.33 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  29.65 
 
 		 386 aa  159  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.36 
 
 		 389 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.35 
 
 		 385 aa  156  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  29.6 
 
 		 392 aa  155  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  28 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  27 
 
 		 390 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  29.35 
 
 		 392 aa  152  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  29.35 
 
 		 392 aa  152  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.31 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  31.16 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  28.86 
 
 		 392 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  28.86 
 
 		 392 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  28.86 
 
 		 392 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  28.86 
 
 		 392 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  28.86 
 
 		 406 aa  149  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  28.61 
 
 		 392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  32.26 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.29 
 
 		 389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.44 
 
 		 388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  28.86 
 
 		 392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  31.41 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  28.91 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  28.5 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  31.07 
 
 		 384 aa  143  7e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  29.28 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  30.85 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  29.23 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  28.89 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.8 
 
 		 392 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  25.31 
 
 		 391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.28 
 
 		 391 aa  136  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  29.13 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  27.27 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  30.45 
 
 		 382 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.68 
 
 		 385 aa  133  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  27.97 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  27.68 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  27.62 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  27.2 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  27.15 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  29.52 
 
 		 385 aa  124  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  29.1 
 
 		 382 aa  123  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  23.9 
 
 		 388 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.9 
 
 		 390 aa  123  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.3 
 
 		 392 aa  122  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  27.2 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  28.8 
 
 		 387 aa  120  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0018  transaminase  26.84 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  25.12 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  27.62 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  28.11 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  26.12 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  28.11 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>