More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_19411 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_23741  L,L-diaminopimelate aminotransferase  74.26 
 
 		 417 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113284 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1066  L,L-diaminopimelate aminotransferase  98.53 
 
 		 408 aa  824    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  73.77 
 
 		 408 aa  646    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0311  L,L-diaminopimelate aminotransferase  75.49 
 
 		 408 aa  654    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19411  L,L-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 408 aa  834    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16911  L,L-diaminopimelate aminotransferase  72.3 
 
 		 408 aa  627  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0853  L,L-diaminopimelate aminotransferase  72.1 
 
 		 411 aa  630  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217772  hitchhiker  0.00920973 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4059  L,L-diaminopimelate aminotransferase  70.76 
 
 		 411 aa  621  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  71.81 
 
 		 408 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.118927  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16221  L,L-diaminopimelate aminotransferase  74.26 
 
 		 408 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.516745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0509  L,L-diaminopimelate aminotransferase  71.43 
 
 		 411 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0494  L,L-diaminopimelate aminotransferase  71.43 
 
 		 411 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2354  L,L-diaminopimelate aminotransferase  70.27 
 
 		 411 aa  617  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1592  L,L-diaminopimelate aminotransferase  70.83 
 
 		 408 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.518523  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16801  L,L-diaminopimelate aminotransferase  69.61 
 
 		 408 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3293  L,L-diaminopimelate aminotransferase  69.78 
 
 		 411 aa  612  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.792404  decreased coverage  0.00697344 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1424  LL-diaminopimelate aminotransferase  69.53 
 
 		 411 aa  607  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4424  L,L-diaminopimelate aminotransferase  68.89 
 
 		 411 aa  605  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0886982 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3995  aminotransferase class I and II  63.97 
 
 		 411 aa  575  1.0000000000000001e-163  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2324  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.88 
 
 		 409 aa  534  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2423  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.18 
 
 		 410 aa  521  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0162  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.44 
 
 		 410 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0213  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.44 
 
 		 410 aa  511  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0427359  hitchhiker  0.00000000000342652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0238  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.95 
 
 		 410 aa  513  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4142  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.97 
 
 		 411 aa  510  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4052  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.21 
 
 		 411 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3061  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.71 
 
 		 410 aa  509  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371159  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4564  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.87 
 
 		 411 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3101  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.56 
 
 		 410 aa  504  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1351  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.17 
 
 		 407 aa  502  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4620  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.6 
 
 		 407 aa  503  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1185  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.07 
 
 		 531 aa  502  1e-141  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3040  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.97 
 
 		 410 aa  503  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1014  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.8 
 
 		 409 aa  494  9.999999999999999e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0704  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.95 
 
 		 407 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167221  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2779  L,L-diaminopimelate aminotransferase  54.13 
 
 		 409 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0363182  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0631  L,L-diaminopimelate aminotransferase  52.7 
 
 		 404 aa  463  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.923394  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1151  aminotransferase class I and II  51.46 
 
 		 408 aa  455  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00770  LL-diaminopimelate aminotransferase  47.42 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.386201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22909  predicted protein  48.3 
 
 		 443 aa  353  4e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30412  predicted protein  45.25 
 
 		 402 aa  341  1e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00618284  normal  0.581125 
 
 
-
 
NC_002620  TC0669  L,L-diaminopimelate aminotransferase  42.47 
 
 		 393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  31.84 
 
 		 386 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.43 
 
 		 391 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  31.18 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.28 
 
 		 390 aa  152  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.72 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.41 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  30.45 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  30.55 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  30.73 
 
 		 401 aa  143  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.01 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.78 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  29.61 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.73 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  28.83 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.41 
 
 		 389 aa  133  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  29.24 
 
 		 392 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  28.42 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.61 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.36 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  27.5 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.54 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  28.65 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  28.39 
 
 		 392 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  28.39 
 
 		 392 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  28.39 
 
 		 392 aa  129  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  28.39 
 
 		 392 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  29.15 
 
 		 390 aa  129  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  28.33 
 
 		 387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  28.12 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  27.86 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.53 
 
 		 385 aa  127  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  28.68 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.36 
 
 		 388 aa  126  7e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1454  aminotransferase  27.25 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  hitchhiker  0.000434542 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  27.5 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  27.25 
 
 		 406 aa  123  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  27.25 
 
 		 406 aa  123  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  26.5 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  29.67 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  26.38 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  27.39 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1738  aminotransferase  27.25 
 
 		 405 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.990718  normal  0.152146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1544  aminotransferase  27.25 
 
 		 405 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0018  transaminase  28.46 
 
 		 394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  29.63 
 
 		 384 aa  119  7e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3522  aminotransferase  26.75 
 
 		 406 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0878596  normal  0.459618 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  25.69 
 
 		 385 aa  119  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2278  aminotransferase  26.75 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874685  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.64 
 
 		 392 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  27.12 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  27.46 
 
 		 403 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  25.78 
 
 		 400 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  27.49 
 
 		 401 aa  115  8.999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  26.16 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.4 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  25.74 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3411  aminotransferase  26.03 
 
 		 406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5073  aminotransferase  25.85 
 
 		 409 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>