More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4620 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4620  L,L-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 407 aa  843    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1351  L,L-diaminopimelate aminotransferase  69.21 
 
 		 407 aa  621  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0704  L,L-diaminopimelate aminotransferase  70.76 
 
 		 407 aa  617  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167221  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2779  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.3 
 
 		 409 aa  566  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0363182  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.96 
 
 		 408 aa  534  1e-151  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2354  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.95 
 
 		 411 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4059  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.86 
 
 		 411 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0853  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.25 
 
 		 411 aa  526  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217772  hitchhiker  0.00920973 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1424  LL-diaminopimelate aminotransferase  61.46 
 
 		 411 aa  526  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3995  aminotransferase class I and II  59.27 
 
 		 411 aa  522  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3293  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.98 
 
 		 411 aa  523  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.792404  decreased coverage  0.00697344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3101  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.16 
 
 		 410 aa  521  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.04 
 
 		 408 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.118927  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0494  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.23 
 
 		 411 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0311  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.99 
 
 		 408 aa  514  1e-144  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16911  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.04 
 
 		 408 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0509  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.23 
 
 		 411 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4564  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.98 
 
 		 411 aa  509  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273776  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1592  L,L-diaminopimelate aminotransferase  56.54 
 
 		 408 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.518523  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16801  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.53 
 
 		 408 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4424  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.15 
 
 		 411 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0886982 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23741  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.75 
 
 		 417 aa  507  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113284 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1066  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.6 
 
 		 408 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2324  L,L-diaminopimelate aminotransferase  55.5 
 
 		 409 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19411  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.6 
 
 		 408 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4052  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.05 
 
 		 411 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1014  L,L-diaminopimelate aminotransferase  56.16 
 
 		 409 aa  501  1e-140  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4142  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.56 
 
 		 411 aa  498  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3061  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.56 
 
 		 410 aa  495  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3040  L,L-diaminopimelate aminotransferase  56.34 
 
 		 410 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0162  L,L-diaminopimelate aminotransferase  56.83 
 
 		 410 aa  491  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2423  L,L-diaminopimelate aminotransferase  56.72 
 
 		 410 aa  489  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0213  L,L-diaminopimelate aminotransferase  56.34 
 
 		 410 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0427359  hitchhiker  0.00000000000342652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0238  L,L-diaminopimelate aminotransferase  56.59 
 
 		 410 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1151  aminotransferase class I and II  56.19 
 
 		 408 aa  485  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1185  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.99 
 
 		 531 aa  483  1e-135  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16221  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.01 
 
 		 408 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.516745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0631  L,L-diaminopimelate aminotransferase  54.19 
 
 		 404 aa  462  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.923394  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00770  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.25 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.386201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30412  predicted protein  42.57 
 
 		 402 aa  325  6e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00618284  normal  0.581125 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22909  predicted protein  43.34 
 
 		 443 aa  313  4.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0669  L,L-diaminopimelate aminotransferase  38.27 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  31.42 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  32.1 
 
 		 390 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  32.13 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  31.18 
 
 		 395 aa  150  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.73 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.51 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  28.43 
 
 		 396 aa  143  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.85 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  31 
 
 		 392 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  31.51 
 
 		 389 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.34 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  31.09 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  30.64 
 
 		 401 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.27 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.43 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.78 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.46 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  27.83 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  32.1 
 
 		 382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  31.18 
 
 		 382 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.85 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  27.59 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.46 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  27.18 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  29.55 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.68 
 
 		 388 aa  130  6e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  27.99 
 
 		 384 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  27.34 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  27.34 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  27.34 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  27.34 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  27.62 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  27.12 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  29.31 
 
 		 403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  28.5 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  27.41 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  26.9 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  31.25 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  29.01 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.74 
 
 		 392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  28.87 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  28.67 
 
 		 406 aa  126  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  28.67 
 
 		 406 aa  126  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  27.62 
 
 		 412 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  27.4 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  30.37 
 
 		 384 aa  123  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  27.37 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  27.37 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  27.37 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  27.37 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  27.37 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  27.37 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  27.37 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  27.37 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  27.37 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  27.37 
 
 		 412 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0018  transaminase  28.35 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  27.37 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>