More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3293 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0494  L,L-diaminopimelate aminotransferase  83.21 
 
 
411 aa  729    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2354  L,L-diaminopimelate aminotransferase  85.16 
 
 
411 aa  743    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0853  L,L-diaminopimelate aminotransferase  82.96 
 
 
411 aa  711    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217772  hitchhiker  0.00920973 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4059  L,L-diaminopimelate aminotransferase  85.89 
 
 
411 aa  740    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4424  L,L-diaminopimelate aminotransferase  80.44 
 
 
411 aa  703    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0886982 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3293  L,L-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 
411 aa  849    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.792404  decreased coverage  0.00697344 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0509  L,L-diaminopimelate aminotransferase  83.21 
 
 
411 aa  729    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1424  LL-diaminopimelate aminotransferase  82.73 
 
 
411 aa  721    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23741  L,L-diaminopimelate aminotransferase  72.39 
 
 
417 aa  631  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113284 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  72.1 
 
 
408 aa  629  1e-179  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0311  L,L-diaminopimelate aminotransferase  73.33 
 
 
408 aa  629  1e-179  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3995  aminotransferase class I and II  68.8 
 
 
411 aa  618  1e-176  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1066  L,L-diaminopimelate aminotransferase  69.78 
 
 
408 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19411  L,L-diaminopimelate aminotransferase  69.78 
 
 
408 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16911  L,L-diaminopimelate aminotransferase  69.63 
 
 
408 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  68.89 
 
 
408 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.118927  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16801  L,L-diaminopimelate aminotransferase  68.4 
 
 
408 aa  604  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1592  L,L-diaminopimelate aminotransferase  68.64 
 
 
408 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.518523  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16221  L,L-diaminopimelate aminotransferase  69.7 
 
 
408 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.516745  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0238  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.68 
 
 
410 aa  551  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1185  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.77 
 
 
531 aa  553  1e-156  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2423  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.57 
 
 
410 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4142  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.68 
 
 
411 aa  551  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4052  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.68 
 
 
411 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0162  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.93 
 
 
410 aa  545  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3061  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.2 
 
 
410 aa  545  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0213  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.93 
 
 
410 aa  543  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0427359  hitchhiker  0.00000000000342652 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3040  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.95 
 
 
410 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3101  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.73 
 
 
410 aa  531  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1351  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.14 
 
 
407 aa  531  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0206949  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2324  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.17 
 
 
409 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4620  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.98 
 
 
407 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4564  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.85 
 
 
411 aa  518  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273776  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0704  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.22 
 
 
407 aa  509  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167221  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1014  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.48 
 
 
409 aa  503  1e-141  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2779  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.95 
 
 
409 aa  489  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0363182  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1151  aminotransferase class I and II  54.57 
 
 
408 aa  478  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0631  L,L-diaminopimelate aminotransferase  55.67 
 
 
404 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.923394  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00770  LL-diaminopimelate aminotransferase  49.51 
 
 
424 aa  404  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.386201  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30412  predicted protein  46.17 
 
 
402 aa  350  2e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00618284  normal  0.581125 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22909  predicted protein  45.57 
 
 
443 aa  331  1e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0669  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40.94 
 
 
393 aa  287  2e-76  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.43 
 
 
387 aa  161  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.2 
 
 
390 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  30.94 
 
 
386 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.45 
 
 
388 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  31.49 
 
 
388 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  28 
 
 
391 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  30.56 
 
 
390 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.4 
 
 
389 aa  149  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  31.32 
 
 
395 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  29.56 
 
 
401 aa  146  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.35 
 
 
389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.76 
 
 
388 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  28.68 
 
 
392 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.53 
 
 
385 aa  143  6e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  28.75 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  28 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  28 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  28 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  28 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  28.18 
 
 
406 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  27.82 
 
 
392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  27.75 
 
 
392 aa  139  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  27.82 
 
 
392 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  28.39 
 
 
396 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  27.75 
 
 
392 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  28.81 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  26.84 
 
 
400 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  29.28 
 
 
384 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.58 
 
 
385 aa  133  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.06 
 
 
392 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  29.66 
 
 
392 aa  132  7.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  27.63 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  29.95 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  26.25 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.25 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  28.01 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  26.87 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  27.59 
 
 
382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  27.89 
 
 
403 aa  130  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.51 
 
 
390 aa  130  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  27.37 
 
 
391 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0018  transaminase  29.06 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  29.92 
 
 
387 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  29.17 
 
 
384 aa  125  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.18 
 
 
388 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  28.53 
 
 
388 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  28.5 
 
 
392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  27.53 
 
 
393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  26.51 
 
 
411 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  26.07 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  26.25 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  27.09 
 
 
382 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  28.57 
 
 
382 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  25.98 
 
 
394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  27.39 
 
 
385 aa  117  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.02 
 
 
392 aa  117  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  26.24 
 
 
385 aa  116  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0567  aminotransferase class I and II  26.61 
 
 
403 aa  116  7.999999999999999e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>