More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3318 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3318  inner-membrane translocator  100 
 
 		 297 aa  558  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2847  inner-membrane translocator  50.18 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.313768  normal  0.521015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3690  inner-membrane translocator  48.43 
 
 		 610 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00194124  normal  0.651023 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0703  inner-membrane translocator  44.71 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0248048  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  37.99 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  38.03 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  38.04 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  38.1 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  41.49 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  38.13 
 
 		 290 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  39.5 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  40 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0852  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147102  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  36.97 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  37.68 
 
 		 290 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  37.68 
 
 		 290 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  41.15 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  37.24 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0761  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  38.52 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  36.4 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2459  inner-membrane translocator  39.11 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  36.5 
 
 		 283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  38.43 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  38.04 
 
 		 315 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1494  inner-membrane translocator  38.43 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  37.3 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 628 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4400  inner-membrane translocator  38.25 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2390  inner-membrane translocator  35.61 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0318684  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  40.16 
 
 		 306 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  36.15 
 
 		 282 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  39.92 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1580  inner-membrane translocator  31.11 
 
 		 288 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.21 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1587  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4609  inner-membrane translocator  40 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1400  inner-membrane translocator  37.6 
 
 		 342 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704678  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4487  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0225  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 317 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3309  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 317 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322821  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0365  inner-membrane translocator  39.76 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1861  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2933  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0799097  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1680  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2024  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.266794  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 291 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4558  inner-membrane translocator  30.37 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.815893  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2929  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1392  inner-membrane translocator  37.74 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.192179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1573  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 315 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1414  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 311 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0932  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 311 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0635  inner-membrane translocator  36 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1901  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 311 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.214126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4565  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 315 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4558  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.07 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3168  inner-membrane translocator  34.87 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 652 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  34.53 
 
 		 628 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0194  inner-membrane translocator  39.19 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4168  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1579  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.687848 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1294  inner-membrane translocator  37.36 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 286 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6488  inner-membrane translocator  36.6 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115929  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1333  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0102274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2421  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719223  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2062  inner-membrane translocator  33.08 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.813813  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 637 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1977  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 626 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2577  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.541212  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2810  inner-membrane translocator  32.95 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144743  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5706  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  31.48 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.956551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7685  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2554  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639448  normal  0.862916 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3674  putative urea/short-chain amide transport system permease protein  32.95 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473884  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>