205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1303 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1303  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 
155 aa  314  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3133  putative transcriptional regulator  80.52 
 
 
155 aa  269  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  44.44 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  44.44 
 
 
157 aa  138  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  42.21 
 
 
154 aa  137  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  43.79 
 
 
157 aa  136  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  43.59 
 
 
159 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  42.76 
 
 
153 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  43.79 
 
 
157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  43.79 
 
 
157 aa  134  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  43.14 
 
 
157 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  42.11 
 
 
157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  42.11 
 
 
157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0302  hypothetical protein  47.33 
 
 
155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  46.67 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  39.47 
 
 
157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2252  hypothetical protein  41.83 
 
 
157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.89628e-27 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4335  putative transcriptional regulator  43.95 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3420  hypothetical protein  44.59 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82049  normal  0.0336552 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2421  hypothetical protein  42.68 
 
 
163 aa  101  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11336  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  37.42 
 
 
160 aa  97.1  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  34.84 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  41.18 
 
 
162 aa  82  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  46.49 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  39.84 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  43.59 
 
 
150 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  36.29 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  36.94 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  37.23 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  34.07 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  39.16 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  31.76 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  33.11 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  32.59 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  32.26 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  33.78 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  36.99 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  30.92 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  36.91 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  32.21 
 
 
166 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  36.43 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  32.79 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  34.81 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  34.19 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  29.81 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  30.82 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  30.99 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  36.36 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  28.48 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  26.74 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0535  hypothetical protein  36.81 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  35.42 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  34.42 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  36.43 
 
 
265 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  39.84 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  34.69 
 
 
145 aa  67  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  36.17 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  32.64 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  37.1 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  31.58 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  28.66 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  29.46 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  28.39 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  32.58 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39681  predicted protein  32.62 
 
 
336 aa  65.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0134522  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  31.06 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  30.56 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  40.78 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  34.04 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  31.91 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  33.78 
 
 
235 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02964  hypothetical protein  30.14 
 
 
239 aa  63.9  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  33.78 
 
 
246 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  42.53 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  30.43 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  33.78 
 
 
246 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  36.92 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  33.78 
 
 
246 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  33.83 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  33.78 
 
 
246 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  33.76 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  31.03 
 
 
294 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0423  hypothetical protein  35.85 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.237616  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  33.58 
 
 
234 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  34.51 
 
 
231 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  27.63 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  34.56 
 
 
251 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  38.83 
 
 
162 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  31.01 
 
 
131 aa  62.4  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  33.11 
 
 
235 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  34.59 
 
 
239 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  33.8 
 
 
231 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  31.4 
 
 
196 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  33.33 
 
 
144 aa  60.8  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10437  predicted protein  37.19 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  29.33 
 
 
166 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3831  protein of unknown function UPF0066  28.29 
 
 
158 aa  60.5  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>