More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1289 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1289  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
610 aa  1242    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172232  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33360  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  39.68 
 
 
549 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.722475  normal  0.940695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5913  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  36.33 
 
 
593 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0808698  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2586  extracellular solute-binding protein family 5  37.21 
 
 
603 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653336  decreased coverage  0.00337365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  37.1 
 
 
587 aa  373  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1850  extracellular solute-binding protein family 5  36.92 
 
 
584 aa  363  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33430  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  35.87 
 
 
562 aa  361  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2296  extracellular solute-binding protein family 5  37.72 
 
 
584 aa  360  5e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000797709  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1553  extracellular solute-binding protein family 5  35.14 
 
 
587 aa  342  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.525667  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1286  extracellular solute-binding protein family 5  36.65 
 
 
594 aa  333  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3512  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  34.36 
 
 
568 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321069  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4557  extracellular solute-binding protein family 5  32.67 
 
 
570 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2457  extracellular solute-binding protein family 5  31.73 
 
 
562 aa  220  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2049  extracellular solute-binding protein family 5  29.6 
 
 
595 aa  217  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4719  4-phytase  30.4 
 
 
564 aa  216  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0883166  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.8 
 
 
573 aa  212  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0438  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 
569 aa  192  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000302418 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.6 
 
 
560 aa  182  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2982  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 
573 aa  163  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270832  normal  0.0254721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7148  extracellular solute-binding protein family 5  28.94 
 
 
586 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.46 
 
 
540 aa  153  8e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5507  extracellular solute-binding protein family 5  27.24 
 
 
582 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 
540 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 
538 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  28.15 
 
 
539 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  28.09 
 
 
540 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  26.38 
 
 
566 aa  140  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
538 aa  131  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5889  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 
595 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5634  hypothetical protein  26.69 
 
 
568 aa  124  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00869862  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12470  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.97 
 
 
614 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185176  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0438  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 
549 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2178  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 
561 aa  114  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 
535 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
516 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 
590 aa  107  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2400  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 
599 aa  100  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  23.58 
 
 
520 aa  99  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2177  extracellular solute-binding protein family 5  23.92 
 
 
554 aa  96.3  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2171  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 
580 aa  94.4  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.596914  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 
526 aa  93.6  9e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  23.95 
 
 
544 aa  92.8  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.1 
 
 
521 aa  92  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.1 
 
 
521 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.1 
 
 
521 aa  91.3  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.1 
 
 
521 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
521 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  23.33 
 
 
544 aa  90.5  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  25.97 
 
 
516 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
516 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  24.76 
 
 
505 aa  88.2  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  25.78 
 
 
516 aa  87  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 
545 aa  86.3  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  22.32 
 
 
515 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  24.77 
 
 
516 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 
551 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 
525 aa  85.5  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  25.58 
 
 
516 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3425  extracellular solute-binding protein family 5  22.89 
 
 
563 aa  83.2  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  25.58 
 
 
516 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  26.34 
 
 
524 aa  82.8  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1920  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 
607 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689476  normal  0.0152046 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
594 aa  82.4  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 
531 aa  82.8  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_932  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  23.64 
 
 
558 aa  81.3  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000268358  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  24.89 
 
 
520 aa  81.3  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 
527 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0943  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 
558 aa  80.9  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0446161  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  23.98 
 
 
530 aa  80.5  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 
523 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.88 
 
 
512 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4118  family 1 extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 
543 aa  79.3  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  25.19 
 
 
516 aa  79.3  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  21.38 
 
 
543 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5381  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  24.25 
 
 
524 aa  78.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 
512 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1855  twin-arginine translocation pathway signal  23.21 
 
 
540 aa  78.2  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686889  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.52 
 
 
508 aa  78.2  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  22.63 
 
 
512 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  23.4 
 
 
523 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  24.15 
 
 
532 aa  77.4  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.68 
 
 
512 aa  77.4  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.68 
 
 
512 aa  77.4  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.68 
 
 
512 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  22.45 
 
 
552 aa  77  0.0000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.68 
 
 
512 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  26.65 
 
 
528 aa  77  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  22.68 
 
 
493 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  21.17 
 
 
543 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  22.68 
 
 
512 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  24.14 
 
 
520 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  21.17 
 
 
543 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  22.68 
 
 
512 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  21.17 
 
 
543 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 
529 aa  77  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  24.55 
 
 
530 aa  76.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  22.44 
 
 
512 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  22.24 
 
 
512 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  22.24 
 
 
512 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B15  oligopeptide ABC transporter OppAIV  23.34 
 
 
530 aa  76.3  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.470524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>