57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1213 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1213  type IV pilus modification protein PilV  100 
 
 		 193 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  36.36 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1063  type IV pilus modification protein PilV  34.04 
 
 		 183 aa  97.8  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2953  type IV pilus modification protein PilV  35.53 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.192573  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1103  type IV pilus modification protein PilV  35.16 
 
 		 173 aa  94  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2719  methylation  36.96 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3528  hypothetical protein  34.52 
 
 		 187 aa  85.9  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1160  type IV pilus modification protein PilV  32.12 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.574429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1125  type IV pilus modification protein PilV  31.77 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2886  type IV pilus modification protein PilV  30.32 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.313421  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3035  type IV pilus modification protein PilV  35.26 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3231  type IV pilus modification protein PilV  30.85 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1087  type IV pilus modification protein PilV  30.69 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1058  type IV pilus modification protein PilV  30.73 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0928  type IV pilus assembly protein PilV  35.52 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1295  type IV pilus modification protein PilV  32.6 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.444338 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1198  type IV pilus modification protein PilV  33.7 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  31.58 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2914  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  31.33 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5686  Type IV fimbrial biogenesis, pilV-related transmembrane protein  29.06 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2881  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  31.74 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0090  type IV fimbrial biogenesis protein PilV, putative  28.96 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.662578  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0854  type IV pilus modification protein PilV  36.71 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3168  type IV pilus modification protein PilV  36.71 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  32.77 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  44.07 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  34.19 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  30.12 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  45.9 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  45.61 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  47.27 
 
 		 155 aa  51.2  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  32.28 
 
 		 225 aa  51.2  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2678  type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  30.69 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2665  type IV pilus modification protein PilV  46.43 
 
 		 160 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  41.94 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  41.94 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2822  type IV pilus modification protein PilV  26.53 
 
 		 223 aa  48.9  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  32.41 
 
 		 156 aa  49.3  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11840  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilV-like protein  31.97 
 
 		 177 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  37.31 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2838  type IV pilus modification protein PilV  28.48 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0708061  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0024  pre-pilin leader sequence  43.08 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0020  type IV pilus modification protein PilV  43.08 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.908433  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2536  type IV pilus modification protein PilV  26.92 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  30.36 
 
 		 157 aa  45.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03026  hypothetical protein  38.33 
 
 		 220 aa  45.1  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3405  fimbrial biogenesis protein  47.92 
 
 		 151 aa  45.1  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0016  type IV pilus modification protein PilV  38.82 
 
 		 159 aa  44.7  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  36.84 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0486  methylation  41.51 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0401  type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  31.52 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3039  hypothetical protein  33.85 
 
 		 128 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.430738  normal  0.140833 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0213  type IV pilus modification protein PilV  33.12 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.035208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  40.68 
 
 		 165 aa  42  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0668  hypothetical protein  30 
 
 		 179 aa  41.6  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2023  hypothetical protein  30.39 
 
 		 180 aa  41.2  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0714  type IV pilus modification protein PilV  30.77 
 
 		 167 aa  41.2  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>