248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0574 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0574  putative ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 432 aa  884    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2407  hypothetical protein  30.07 
 
 		 438 aa  206  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2240  hypothetical protein  30.52 
 
 		 435 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3363  hypothetical protein  32.41 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0724  hypothetical protein  31.14 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4071  hypothetical protein  30.18 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1020  protein of unknown function DUF214  32.74 
 
 		 436 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3340  hypothetical protein  32.51 
 
 		 436 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2990  hypothetical protein  32.95 
 
 		 436 aa  177  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1032  hypothetical protein  32.51 
 
 		 436 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0999  hypothetical protein  32.29 
 
 		 436 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3158  hypothetical protein  30.93 
 
 		 434 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3259  hypothetical protein  30.68 
 
 		 434 aa  173  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0864  hypothetical protein  30.68 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3502  protein of unknown function DUF214  30.28 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592439  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0899  hypothetical protein  29.37 
 
 		 437 aa  169  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.811824  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3721  hypothetical protein  30.91 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.232567  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2849  hypothetical protein  29.91 
 
 		 436 aa  160  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2863  hypothetical protein  28.51 
 
 		 435 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3929  protein of unknown function DUF214  28.08 
 
 		 432 aa  120  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  25.07 
 
 		 804 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  24.71 
 
 		 805 aa  73.2  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.65 
 
 		 805 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.73 
 
 		 882 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.64 
 
 		 805 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  23.93 
 
 		 797 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  23.55 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.92 
 
 		 807 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  24.13 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.88 
 
 		 823 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  24.82 
 
 		 887 aa  63.5  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  24.34 
 
 		 789 aa  63.5  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  22.37 
 
 		 821 aa  63.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  22.36 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25 
 
 		 808 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.5 
 
 		 805 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.82 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  23.91 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2234  hypothetical protein  21.81 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.25 
 
 		 809 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  24.67 
 
 		 819 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  23.61 
 
 		 816 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  22.89 
 
 		 803 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  26.95 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.21 
 
 		 822 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  23.97 
 
 		 808 aa  60.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1760  protein of unknown function DUF214  28.16 
 
 		 798 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962231  normal  0.806233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  22.52 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  22.04 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  22.32 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  24.58 
 
 		 887 aa  60.1  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  22.05 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  34.68 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  23.43 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  23.79 
 
 		 805 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  22.25 
 
 		 809 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  24.66 
 
 		 803 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.53 
 
 		 812 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.95 
 
 		 893 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  21.78 
 
 		 804 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  18.21 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  20.51 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  21.03 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  25.33 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  22.64 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  25.97 
 
 		 809 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  21.07 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  23.68 
 
 		 808 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_002950  PG0281  ABC transporter, permease protein, putative  28.03 
 
 		 458 aa  55.1  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7079  protein of unknown function DUF214  22.59 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  19.16 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  22.86 
 
 		 802 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4859  protein of unknown function DUF214  19.75 
 
 		 792 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0508357 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  22.99 
 
 		 400 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  20.59 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5612  protein of unknown function DUF214  22.26 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  20.9 
 
 		 810 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.31 
 
 		 862 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.59 
 
 		 817 aa  53.9  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  22.37 
 
 		 796 aa  53.5  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  23.4 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  24.2 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4614  protein of unknown function DUF214  21.39 
 
 		 801 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.122129 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  22.2 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.08 
 
 		 807 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.67 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1804  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 		 802 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  23.9 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  24.2 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  22.78 
 
 		 810 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  32.58 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  19.38 
 
 		 403 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  22.03 
 
 		 810 aa  51.2  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  21.17 
 
 		 784 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  20.05 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  20.63 
 
 		 831 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  24.52 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4641  protein of unknown function DUF214  34.21 
 
 		 836 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0388606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  21.24 
 
 		 848 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>