209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0336 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0336  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 		 223 aa  437  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0158598  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3162  cyclic nucleotide-binding protein  43.56 
 
 		 230 aa  184  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3165  transcriptional regulator  43.56 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3454  cyclic nucleotide-binding domain protein  43.56 
 
 		 230 aa  181  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.636337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1794  cyclic nucleotide-binding domain protein  44 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3470  cyclic nucleotide-binding domain protein  43.11 
 
 		 230 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3255  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  43.56 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00717521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3228  transcriptional regulator  43.56 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000617944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3510  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  43.56 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3481  cyclic nucleotide-binding domain protein  43.56 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0295032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3461  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  42.15 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5089  DNA-binding transcriptional activator YeiL  31.53 
 
 		 223 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5419  DNA-binding transcriptional activator YeiL  31.08 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5533  DNA-binding transcriptional activator YeiL  30.63 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5538  DNA-binding transcriptional activator YeiL  31.08 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5261  DNA-binding transcriptional activator YeiL  31.53 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00514717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5106  DNA-binding transcriptional activator YeiL  31.53 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.888495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5659  DNA-binding transcriptional activator YeiL  31.53 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5504  DNA-binding transcriptional activator YeiL  31.53 
 
 		 223 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5589  DNA-binding transcriptional activator YeiL  31.08 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2368  catabolite gene activator  34.45 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2419  catabolite gene activator  33.63 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5203  DNA-binding transcriptional activator YeiL  30.18 
 
 		 223 aa  121  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2964  catabolite gene activator  33.83 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117686  normal  0.0504815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2212  cyclic nucleotide-binding protein  32.13 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3735  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.39 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0206  transcriptional regulator  30.54 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000707778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2310  DNA-binding transcriptional activator YeiL  25.94 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  decreased coverage  0.000186485 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1894  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.2 
 
 		 214 aa  102  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000758315  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1495  cyclic nucleotide-binding protein  25.47 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  25.47 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288775  normal  0.0803895 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3786  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0919672  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2460  DNA-binding transcriptional activator YeiL  27.6 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.572747  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1300  cyclic nucleotide-binding protein  37.91 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02092  DNA-binding transcriptional activator of stationary phase nitrogen survival  27.08 
 
 		 219 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02051  hypothetical protein  27.08 
 
 		 219 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1485  DNA-binding transcriptional activator YeiL  27.08 
 
 		 219 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0399687  hitchhiker  0.0009131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  27.08 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266371  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0522  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.81 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192194  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.46 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.28 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.34 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.65 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1761  cyclic nucleotide-binding protein  25.13 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2638  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.22 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.81 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0458  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.74 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0401  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.74 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.91 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6981  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.4 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1785  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.53 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0388  cyclic nucleotide-binding protein  25.26 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.76 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0644  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.58 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000386152  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2020  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.5 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0424227  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1578  CRP/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.22 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1214  cyclic nucleotide-binding protein  25.47 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988172  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1241  cyclic nucleotide-binding protein  25.35 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.357414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.32 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000333  predicted N-ribosylNicotinamide CRP-like regulator  23.89 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000153311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.75 
 
 		 348 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  19.55 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.32 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.02 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.94 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.64 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.75 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  16.4 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 230 aa  52  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0756  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.53 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.05 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4277  Crp/FNR family transcriptional regulator  17.11 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1844  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128261  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0647  nitrogen fixation regulation protein fixk  24.75 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3898  regulatory protein Crp  21.46 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4266  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.46 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  0.522306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.83 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.31 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1312  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000433355  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.97 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_004310  BR0654  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.09 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06137  hypothetical protein  21.86 
 
 		 226 aa  48.9  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2027  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.61 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0375  Crp/Fnr family transcriptional regulator  19.68 
 
 		 196 aa  48.5  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.887845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0903  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 287 aa  48.1  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>