59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB00410 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  695    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  34.98 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  30.5 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  31.77 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  34.85 
 
 
302 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  35.22 
 
 
294 aa  106  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  33.77 
 
 
277 aa  105  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  30.45 
 
 
278 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  30.45 
 
 
278 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  30.45 
 
 
280 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  33.21 
 
 
285 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  30.48 
 
 
286 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  34.32 
 
 
349 aa  102  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  28.1 
 
 
285 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  30.38 
 
 
282 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  28.9 
 
 
285 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  28.57 
 
 
291 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  35.71 
 
 
301 aa  99.8  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  31.54 
 
 
286 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  30.5 
 
 
281 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  30.5 
 
 
285 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  33.47 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  30.16 
 
 
280 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  33.47 
 
 
301 aa  97.1  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  29.68 
 
 
286 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  31.15 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  30.65 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  31.15 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  30.53 
 
 
283 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  30.32 
 
 
277 aa  92.8  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  31.68 
 
 
285 aa  92.4  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  28.85 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  30.16 
 
 
379 aa  90.9  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  29.13 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  30.13 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  29.18 
 
 
278 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  28.85 
 
 
283 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  33.19 
 
 
285 aa  89.7  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  30.53 
 
 
281 aa  89.7  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  30.42 
 
 
286 aa  89.7  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  30.43 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  29.13 
 
 
275 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  29.91 
 
 
288 aa  86.3  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  30.29 
 
 
283 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  30.36 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  31.09 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  29 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  30 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  31.86 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  30.71 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  28.24 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  31.09 
 
 
285 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  28.83 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  30.2 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  29.83 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  24.41 
 
 
296 aa  53.9  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  31.48 
 
 
287 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  26.52 
 
 
274 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  31.82 
 
 
292 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>