More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1052 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  45.5 
 
 		 1009 aa  794    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1177  AcrB/AcrD/AcrF family protein  99.6 
 
 		 1005 aa  1971    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0988  integral membrane component of efflux system  63.88 
 
 		 1004 aa  1263    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  39.56 
 
 		 1013 aa  655    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0749  AcrB/AcrD/AcrF family protein  98.01 
 
 		 1005 aa  1943    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0686  RND transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) and heavy metal efflux (HME) families, permease protein  46.39 
 
 		 1008 aa  835    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1052  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1005 aa  1977    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  31.3 
 
 		 1055 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  31.25 
 
 		 1038 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  33.07 
 
 		 1028 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  32.45 
 
 		 1028 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  29.64 
 
 		 1032 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  29.81 
 
 		 1496 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  29.79 
 
 		 1047 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 		 1470 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  29.83 
 
 		 1065 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1036 aa  446  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  30.14 
 
 		 1034 aa  446  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  30.46 
 
 		 1041 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  28.02 
 
 		 1050 aa  439  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  32.41 
 
 		 1028 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  28.2 
 
 		 1033 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  31.63 
 
 		 1028 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  29.8 
 
 		 1039 aa  431  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  29.48 
 
 		 1038 aa  426  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  28.33 
 
 		 1035 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 		 1011 aa  425  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  29.38 
 
 		 1045 aa  426  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3554  multidrug efflux system subunit MdtC  27.8 
 
 		 1026 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2374  acriflavin resistance protein  28.29 
 
 		 1034 aa  422  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  28.8 
 
 		 1022 aa  420  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  28.36 
 
 		 1014 aa  419  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4182  acriflavin resistance protein  28.51 
 
 		 1033 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.559486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  28.04 
 
 		 1095 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  29.38 
 
 		 1044 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4294  acriflavin resistance protein  28.51 
 
 		 1033 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.95 
 
 		 1032 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  27.56 
 
 		 1070 aa  414  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03143  drug efflux transmembrane protein  28.27 
 
 		 1033 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  27.23 
 
 		 1037 aa  412  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  28.67 
 
 		 1034 aa  410  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  28.7 
 
 		 1029 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 		 1031 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2958  acriflavin resistance protein  28.24 
 
 		 1029 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451188  normal  0.893752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 		 1042 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1088 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  28.36 
 
 		 1035 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  28.72 
 
 		 1075 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 		 1071 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  28.02 
 
 		 1044 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  29.73 
 
 		 1058 aa  403  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  28.86 
 
 		 1039 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  27.8 
 
 		 1041 aa  406  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  27.84 
 
 		 1069 aa  405  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1330  multidrug efflux system subunit MdtC  27.3 
 
 		 1024 aa  402  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  28.54 
 
 		 1040 aa  402  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2704  multidrug efflux system subunit MdtC  27.55 
 
 		 1030 aa  402  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3536  putative component of multidrug efflux pump, mdtB-like protein  27.66 
 
 		 1048 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1213  multidrug efflux system subunit MdtC  27.3 
 
 		 1024 aa  402  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286734  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5557  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.98 
 
 		 1032 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130118  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2258  acriflavin resistance protein  28.02 
 
 		 1053 aa  402  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456797  normal  0.166006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  27.79 
 
 		 1032 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  28.29 
 
 		 1068 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  29.84 
 
 		 1044 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3101  multidrug efflux system subunit MdtC  27.3 
 
 		 1024 aa  399  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0416497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 		 1055 aa  399  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  28.19 
 
 		 1041 aa  395  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  28.52 
 
 		 1088 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1232  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 		 1051 aa  395  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.363088  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2830  acriflavin resistance protein  28.13 
 
 		 1092 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1204  multidrug efflux system subunit MdtC  27.6 
 
 		 1029 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.357144  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  29.57 
 
 		 1026 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  27.66 
 
 		 1031 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  26.15 
 
 		 1048 aa  395  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  27.47 
 
 		 1044 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  28.46 
 
 		 1063 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.37 
 
 		 1031 aa  391  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  28.23 
 
 		 1088 aa  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2523  acriflavin resistance protein  27.59 
 
 		 1035 aa  391  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2968  multidrug efflux system subunit MdtC  27.95 
 
 		 1026 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2375  acriflavin resistance protein  27.81 
 
 		 1103 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296544 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1515  acriflavin resistance protein  28.08 
 
 		 1038 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  27.56 
 
 		 1031 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  27.56 
 
 		 1031 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  27.97 
 
 		 1031 aa  390  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3583  acriflavin resistance protein  27.59 
 
 		 1035 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  27.35 
 
 		 1062 aa  389  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4555  acriflavin resistance protein  28.07 
 
 		 1042 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296261  normal  0.764409 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2756  acriflavin resistance protein  27.17 
 
 		 1042 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0866619  normal  0.681611 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1310  multidrug efflux system subunit MdtC  28.05 
 
 		 1026 aa  389  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3611  acriflavin resistance protein  27.5 
 
 		 1044 aa  388  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  28.49 
 
 		 1048 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3464  Acr family transporter  28.95 
 
 		 1101 aa  385  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  27.79 
 
 		 1042 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  27.74 
 
 		 1036 aa  385  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  27.37 
 
 		 1031 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1066 aa  385  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2331  acriflavin resistance protein  27.49 
 
 		 1035 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0100478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2188  acriflavin resistance protein  27.3 
 
 		 1035 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  29.1 
 
 		 1037 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>