265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3118 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3118  cytochrome C peroxidase  100 
 
 		 662 aa  1376    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  32.15 
 
 		 592 aa  229  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  29.36 
 
 		 626 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  27.97 
 
 		 571 aa  223  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  28.39 
 
 		 598 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  31.21 
 
 		 613 aa  220  5e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  32.29 
 
 		 431 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  32.29 
 
 		 594 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  31.03 
 
 		 607 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  27.71 
 
 		 616 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  29.86 
 
 		 594 aa  183  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  29.97 
 
 		 768 aa  140  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  29.33 
 
 		 352 aa  137  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  28.92 
 
 		 417 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  31.6 
 
 		 369 aa  133  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  29 
 
 		 352 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  27.18 
 
 		 352 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  29.23 
 
 		 399 aa  127  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  30.65 
 
 		 626 aa  127  9e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  28.49 
 
 		 521 aa  126  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  29.39 
 
 		 328 aa  126  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  29.77 
 
 		 358 aa  124  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  30.23 
 
 		 311 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  30.42 
 
 		 346 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  29.25 
 
 		 336 aa  121  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  28.53 
 
 		 353 aa  119  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  28.91 
 
 		 337 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  31.13 
 
 		 379 aa  117  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  28.94 
 
 		 302 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  29.41 
 
 		 398 aa  115  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  28.52 
 
 		 333 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  25.94 
 
 		 431 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  29.34 
 
 		 357 aa  110  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  28.63 
 
 		 361 aa  107  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  26.39 
 
 		 367 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  26.92 
 
 		 398 aa  104  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  26.09 
 
 		 365 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  28.8 
 
 		 352 aa  102  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  29.73 
 
 		 371 aa  102  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  27.69 
 
 		 346 aa  100  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  29.59 
 
 		 353 aa  100  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  29.8 
 
 		 331 aa  100  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  27.27 
 
 		 346 aa  99.8  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  28.43 
 
 		 464 aa  99.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  27.96 
 
 		 427 aa  99  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  28.12 
 
 		 331 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  26.94 
 
 		 322 aa  98.2  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  28.99 
 
 		 330 aa  98.2  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  27.04 
 
 		 334 aa  97.8  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  27.95 
 
 		 398 aa  97.1  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  27.84 
 
 		 339 aa  97.4  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  28.46 
 
 		 344 aa  97.1  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  28.46 
 
 		 344 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  28.35 
 
 		 353 aa  96.3  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  28.63 
 
 		 344 aa  97.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  28.34 
 
 		 345 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  27.38 
 
 		 365 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  27.65 
 
 		 437 aa  96.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  26.69 
 
 		 333 aa  96.3  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  26.44 
 
 		 349 aa  95.9  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  28.97 
 
 		 344 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  26.96 
 
 		 330 aa  95.1  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  28.12 
 
 		 346 aa  95.1  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  26.69 
 
 		 333 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  27.42 
 
 		 345 aa  95.1  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  25.72 
 
 		 333 aa  95.1  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  24.77 
 
 		 361 aa  94.7  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  26.69 
 
 		 333 aa  95.1  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  26.63 
 
 		 358 aa  94.7  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  26.96 
 
 		 347 aa  94.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  27.87 
 
 		 343 aa  94.4  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  26.96 
 
 		 347 aa  94.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  28.75 
 
 		 345 aa  94  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  29.14 
 
 		 459 aa  94  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  29.14 
 
 		 459 aa  94  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  29.14 
 
 		 459 aa  94  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  27.83 
 
 		 330 aa  94.4  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  30.82 
 
 		 378 aa  94  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  27.73 
 
 		 335 aa  94  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  26.09 
 
 		 340 aa  94  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  26.69 
 
 		 330 aa  94  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  26.69 
 
 		 333 aa  94  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  27.04 
 
 		 348 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  26.72 
 
 		 384 aa  93.6  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  26.69 
 
 		 401 aa  93.2  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  29.7 
 
 		 346 aa  93.2  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  26.69 
 
 		 333 aa  92.8  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  27.76 
 
 		 359 aa  92.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  27.82 
 
 		 351 aa  92.8  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  27.03 
 
 		 346 aa  92  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  27.83 
 
 		 352 aa  92.4  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  28 
 
 		 359 aa  91.7  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  28.74 
 
 		 348 aa  91.7  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000355  cytochrome c551 peroxidase  28.33 
 
 		 325 aa  91.7  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  27.59 
 
 		 377 aa  91.3  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  27.21 
 
 		 540 aa  91.3  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  27.21 
 
 		 540 aa  91.3  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  27.21 
 
 		 540 aa  91.3  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  27.21 
 
 		 540 aa  91.3  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  26.23 
 
 		 540 aa  90.5  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>