63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2235 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  100 
 
 		 570 aa  1188    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  23.86 
 
 		 1076 aa  123  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  25.74 
 
 		 621 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  24.09 
 
 		 815 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2851  hypothetical protein  24.25 
 
 		 623 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948008  normal  0.0502598 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  23.19 
 
 		 906 aa  90.5  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  26.07 
 
 		 591 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  26.3 
 
 		 571 aa  69.3  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.96 
 
 		 887 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5258  glycoside hydrolase family 9  28.35 
 
 		 653 aa  67.8  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.35373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  24.6 
 
 		 1601 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  27.03 
 
 		 537 aa  63.9  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  23.71 
 
 		 587 aa  63.5  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  23.9 
 
 		 526 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.03 
 
 		 985 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  29.68 
 
 		 978 aa  61.6  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  29.18 
 
 		 563 aa  61.2  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.65 
 
 		 582 aa  60.5  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  36.71 
 
 		 736 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  27.32 
 
 		 833 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  25.29 
 
 		 864 aa  58.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  27.1 
 
 		 665 aa  57.8  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  23.26 
 
 		 1369 aa  57.8  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  23.55 
 
 		 742 aa  57.8  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  25.11 
 
 		 875 aa  57.4  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  25.36 
 
 		 775 aa  56.6  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.3 
 
 		 998 aa  56.6  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  26.83 
 
 		 880 aa  56.6  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  28.39 
 
 		 2042 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  24.7 
 
 		 1759 aa  57  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  35.9 
 
 		 730 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 		 1137 aa  53.9  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00790  Endoglucanase E-4 precursor, putative  37.5 
 
 		 590 aa  53.9  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.323744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  23.27 
 
 		 1224 aa  53.5  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  39.74 
 
 		 737 aa  53.9  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  25.43 
 
 		 1100 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  22.78 
 
 		 895 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  27.14 
 
 		 578 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  35.9 
 
 		 725 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  24.49 
 
 		 874 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.22 
 
 		 786 aa  52  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03428  hypothetical protein  22.01 
 
 		 579 aa  52  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  20.8 
 
 		 851 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.47 
 
 		 762 aa  51.2  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5748  glycoside hydrolase family 9  26.72 
 
 		 613 aa  50.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.843409  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.66 
 
 		 927 aa  50.4  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  27.63 
 
 		 1452 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 		 739 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  22.64 
 
 		 803 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4776  glycosy hydrolase family protein  23.78 
 
 		 606 aa  48.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.520076  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  21.78 
 
 		 867 aa  47.8  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  28.06 
 
 		 710 aa  47.8  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  23.84 
 
 		 646 aa  47  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  26.26 
 
 		 739 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  29.85 
 
 		 611 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  35.44 
 
 		 990 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  25.52 
 
 		 812 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  28.36 
 
 		 847 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  22.95 
 
 		 949 aa  44.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  21.42 
 
 		 611 aa  44.3  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  27.62 
 
 		 794 aa  44.3  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0525  glycoside hydrolase family 9  21.9 
 
 		 609 aa  43.9  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  26.63 
 
 		 757 aa  43.5  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>